212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3304 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 516 aa  1041    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 516 aa  1041    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  98.04 
 
 		 510 aa  953    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  62.6 
 
 		 546 aa  585  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  52.53 
 
 		 533 aa  496  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  54.73 
 
 		 533 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.41 
 
 		 632 aa  403  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  50.09 
 
 		 754 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  50.09 
 
 		 754 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  50.09 
 
 		 734 aa  399  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5515  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  54.92 
 
 		 382 aa  267  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0633809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  33.01 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  29.61 
 
 		 512 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.35 
 
 		 498 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.29 
 
 		 465 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2624  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.19 
 
 		 544 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.26 
 
 		 521 aa  110  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  33.96 
 
 		 714 aa  103  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.13 
 
 		 504 aa  103  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  29.46 
 
 		 483 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  28.77 
 
 		 498 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  28.84 
 
 		 714 aa  101  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  27.92 
 
 		 517 aa  101  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  31.91 
 
 		 724 aa  100  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  30.67 
 
 		 714 aa  100  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  26.71 
 
 		 720 aa  100  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  32.72 
 
 		 512 aa  100  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  28.99 
 
 		 730 aa  98.2  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  31.92 
 
 		 525 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  28.81 
 
 		 483 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  32.91 
 
 		 735 aa  92  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.74 
 
 		 507 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  30.07 
 
 		 491 aa  92.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  25.95 
 
 		 738 aa  91.3  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.77 
 
 		 507 aa  90.9  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2067  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.45 
 
 		 536 aa  90.5  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.800822 
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  24.19 
 
 		 1522 aa  89.7  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  28.53 
 
 		 502 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  27.81 
 
 		 504 aa  86.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1768  phospholipase D/transphosphatidylase  26.56 
 
 		 592 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346269  normal  0.0112079 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  29.89 
 
 		 515 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  28.9 
 
 		 572 aa  83.2  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  27.41 
 
 		 518 aa  80.9  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.14 
 
 		 701 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  31.69 
 
 		 482 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  29.13 
 
 		 472 aa  78.6  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.55 
 
 		 517 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.74 
 
 		 502 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  31.93 
 
 		 504 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  27.33 
 
 		 803 aa  77  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.6 
 
 		 513 aa  77  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  28.4 
 
 		 510 aa  76.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  26.65 
 
 		 484 aa  76.6  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.55 
 
 		 503 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  30.67 
 
 		 735 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  30.48 
 
 		 739 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3885  phospholipase D/transphosphatidylase  26.67 
 
 		 524 aa  71.2  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12431  predicted protein  23.37 
 
 		 801 aa  71.2  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  24.65 
 
 		 1783 aa  70.9  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  23.35 
 
 		 1821 aa  70.1  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67220  hypothetical protein  30.96 
 
 		 745 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.811015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  28.42 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  30.16 
 
 		 739 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2081  phospholipase D/transphosphatidylase  25.09 
 
 		 475 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.45 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.22 
 
 		 474 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.09 
 
 		 474 aa  63.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  23 
 
 		 505 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  23 
 
 		 505 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  23.15 
 
 		 488 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0490  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  22.57 
 
 		 677 aa  62.8  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.16 
 
 		 486 aa  62  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  23.05 
 
 		 676 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.57 
 
 		 713 aa  62  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  24.5 
 
 		 494 aa  61.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  28.21 
 
 		 732 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  28.21 
 
 		 732 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  24.5 
 
 		 494 aa  61.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  28.48 
 
 		 732 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.89 
 
 		 514 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1132  phospholipase D/transphosphatidylase  25.26 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1167  phospholipase D/transphosphatidylase  26.52 
 
 		 537 aa  60.5  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.613652 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1387  cardiolipin synthetase 2  23.65 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  26.71 
 
 		 451 aa  60.1  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4970  phospholipase D/transphosphatidylase  23.19 
 
 		 684 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  29.32 
 
 		 746 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  23.56 
 
 		 479 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3563  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.18 
 
 		 497 aa  58.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2594  putative phospholipase  26.09 
 
 		 684 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.998213 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  22.93 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06712  Phospholipase D [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874F2]  23.97 
 
 		 833 aa  57.8  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  23.23 
 
 		 419 aa  57  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  22.6 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  22.68 
 
 		 479 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  25.77 
 
 		 479 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0906  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.8 
 
 		 427 aa  56.6  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.811495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  22.68 
 
 		 481 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1821  phospholipase D/Transphosphatidylase  25 
 
 		 486 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  25.82 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  25.24 
 
 		 424 aa  55.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>