More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3285 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  75.54 
 
 		 197 aa  278  6e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  72.34 
 
 		 197 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4911  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3553  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.500909  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3626  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3558  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0369  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87327 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4661  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 208 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3399  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0861975  normal  0.425291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1606  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.752317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5152  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  28.93 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2232  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.347192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  31.16 
 
 		 192 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0364  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113387 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4096  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428343  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  28.43 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3496  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4113  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185648  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2746  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13278  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.627174 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  31.38 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3011  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2461  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000138739  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  33.33 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4718  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  24.77 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1335  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1353  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1371  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  47.37 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3329  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000330103  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 200 aa  52.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 216 aa  52.8  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  28.45 
 
 		 205 aa  52.4  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  52  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 197 aa  52  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0085  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 219 aa  52  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 178 aa  52  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
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NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  52  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 208 aa  52  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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