23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3246 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3184  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  711    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3246  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  711    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3196  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  711    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4587  hypothetical protein  60.23 
 
 
361 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.330538 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4571  hypothetical protein  46.61 
 
 
345 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2168  hypothetical protein  42.56 
 
 
244 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2167  hypothetical protein  62.61 
 
 
126 aa  146  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1214  hypothetical protein  32.29 
 
 
365 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0245598  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2746  hypothetical protein  33.23 
 
 
333 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2652  hypothetical protein  32.6 
 
 
333 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236349  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0383  hypothetical protein  28.19 
 
 
329 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0857  hypothetical protein  27.96 
 
 
327 aa  73.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0098  hypothetical protein  27.06 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000701903  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3972  hypothetical protein  25.75 
 
 
330 aa  72.4  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2011  hypothetical protein  25.45 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.311763  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1998  hypothetical protein  23.69 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.951695  normal  0.103418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6848  hypothetical protein  23.02 
 
 
341 aa  65.9  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1097  hypothetical protein  23.1 
 
 
332 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0586  hypothetical protein  21.51 
 
 
333 aa  63.9  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.704758  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2370  hypothetical protein  22.68 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.124487  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5987  hypothetical protein  24.47 
 
 
407 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2116  hypothetical protein  21.38 
 
 
331 aa  48.9  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.472836  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3387  hypothetical protein  22.26 
 
 
326 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>