More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3232 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  100 
 
 
155 aa  317  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  100 
 
 
155 aa  317  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  100 
 
 
155 aa  317  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  95.48 
 
 
155 aa  305  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  95.48 
 
 
155 aa  305  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  92.9 
 
 
155 aa  297  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  64.94 
 
 
156 aa  224  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  64.29 
 
 
156 aa  220  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  54.25 
 
 
157 aa  189  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  55.19 
 
 
156 aa  186  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  55.19 
 
 
156 aa  179  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  51.61 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  48.7 
 
 
155 aa  169  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  52.26 
 
 
158 aa  168  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  50.65 
 
 
160 aa  167  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  50.32 
 
 
158 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  50 
 
 
159 aa  160  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  48.32 
 
 
163 aa  154  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  46.45 
 
 
158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 
155 aa  97.8  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  39.09 
 
 
153 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 
157 aa  90.9  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  39.09 
 
 
153 aa  90.9  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  39.09 
 
 
153 aa  90.9  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  39.09 
 
 
153 aa  90.9  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  39.09 
 
 
153 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  39.09 
 
 
153 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  39.09 
 
 
153 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  39.09 
 
 
153 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  40.78 
 
 
153 aa  87  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  38.18 
 
 
229 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 
155 aa  84  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0219  NUDIX hydrolase  42.98 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203556  normal  0.450694 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  36.76 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  33.56 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  32.39 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  32.39 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0682  NUDIX hydrolase  41.23 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0132833  normal  0.0334373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  41.44 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  43.27 
 
 
163 aa  77  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  34.31 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  40.5 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  41.35 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  35 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  50.62 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  35 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  34.96 
 
 
530 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2490  MutT/Nudix family protein  33.87 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0847665  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2525  MutT/Nudix family protein  33.06 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000393058  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2763  mutT/nudix family protein  33.06 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000181576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
298 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2595  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
171 aa  67.4  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 
340 aa  66.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  30 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  32.41 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  37.76 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1483  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  31.67 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  31.67 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  31.67 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  31.67 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  31.67 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  31.67 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3701  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.899383  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  31.67 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  33.03 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2431  NUDIX hydrolase  32.19 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960036  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  48.53 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  33.03 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  50 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  61.11 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  28.21 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  43.04 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  28.21 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  31.67 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3063  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
165 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0215  ADP-ribose pyrophosphatase  35.82 
 
 
173 aa  63.2  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0696282  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  49.21 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  31.67 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  48.05 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  49.21 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  49.21 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  53.7 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
212 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  49.21 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3733  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  37.17 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0829824  normal  0.0242018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  40.86 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 
132 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>