105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3199 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  100 
 
 		 277 aa  549  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  100 
 
 		 277 aa  549  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  100 
 
 		 277 aa  549  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  82.12 
 
 		 304 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  80 
 
 		 291 aa  454  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  76.75 
 
 		 278 aa  420  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  62.96 
 
 		 333 aa  348  6e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  67.05 
 
 		 297 aa  328  6e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  59.92 
 
 		 303 aa  300  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  59.46 
 
 		 322 aa  293  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  59.53 
 
 		 295 aa  287  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  55.94 
 
 		 320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  55.13 
 
 		 299 aa  284  9e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  55 
 
 		 351 aa  274  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  55.22 
 
 		 267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  50.19 
 
 		 323 aa  268  7e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  51.92 
 
 		 311 aa  263  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  54.92 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  54.55 
 
 		 302 aa  263  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  53.79 
 
 		 294 aa  261  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  55.51 
 
 		 286 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  53.23 
 
 		 266 aa  260  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  51.85 
 
 		 280 aa  258  8e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  51.53 
 
 		 284 aa  256  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  53.08 
 
 		 273 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  54.37 
 
 		 303 aa  249  4e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  48.46 
 
 		 313 aa  249  4e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  49.61 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  52.09 
 
 		 334 aa  240  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  41.41 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  33.46 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39374  predicted protein  31.17 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  27.02 
 
 		 1019 aa  90.1  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  25.56 
 
 		 411 aa  85.5  9e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  30.51 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  31.77 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  30.57 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  29.72 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  30.68 
 
 		 1052 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  31.05 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  23.89 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  29.79 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  26.9 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  23.35 
 
 		 1016 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  28.85 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0282  hypothetical protein  27.44 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  28.03 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  26.55 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  26.69 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  28.9 
 
 		 781 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4397  hypothetical protein  24.53 
 
 		 615 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.272271 
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  28.57 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  28.62 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  27.07 
 
 		 788 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  24.32 
 
 		 803 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  26.97 
 
 		 788 aa  56.6  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  30.05 
 
 		 1048 aa  55.8  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  23.05 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  31.98 
 
 		 1049 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  26.97 
 
 		 788 aa  54.3  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  28.79 
 
 		 387 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  27.24 
 
 		 387 aa  52.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  27.63 
 
 		 387 aa  52.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5053  hypothetical protein  28.14 
 
 		 267 aa  52.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.609849 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  26.74 
 
 		 781 aa  52.4  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  27.31 
 
 		 387 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  27.24 
 
 		 387 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  27.24 
 
 		 387 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1443  superfamily I DNA/RNA helicase  26.89 
 
 		 920 aa  50.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.000000114812  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  25.57 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  32.38 
 
 		 1094 aa  49.7  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3877  hypothetical protein  31.31 
 
 		 1151 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  33.73 
 
 		 991 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  30.61 
 
 		 958 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2712  hypothetical protein  25.63 
 
 		 543 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000442298  hitchhiker  0.0000400817 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  30.22 
 
 		 855 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  32.47 
 
 		 1135 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  30.77 
 
 		 1062 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  27.33 
 
 		 986 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  32.91 
 
 		 988 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  32.85 
 
 		 915 aa  47  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3434  UvrD/REP helicase  33.12 
 
 		 1187 aa  46.2  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  24.9 
 
 		 783 aa  46.2  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  22.93 
 
 		 263 aa  46.2  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  27.86 
 
 		 1061 aa  46.2  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.54 
 
 		 1048 aa  45.8  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  28.74 
 
 		 1038 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  26.69 
 
 		 1038 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  55.81 
 
 		 993 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0058  UvrD/REP helicase  29.44 
 
 		 1162 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106754  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0018  hypothetical protein  25.85 
 
 		 166 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1321  methyltransferase type 11  24.83 
 
 		 915 aa  44.3  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0207  UvrD/REP helicase  26.91 
 
 		 970 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.00182272  decreased coverage  0.0000000525372 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  29.21 
 
 		 1055 aa  43.9  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  28.68 
 
 		 1059 aa  43.9  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  27.22 
 
 		 1040 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  29.49 
 
 		 997 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  26.35 
 
 		 1051 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  26.35 
 
 		 1051 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3983  hypothetical protein  29.29 
 
 		 1100 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.588967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>