More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3068 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  100 
 
 
407 aa  824  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  52.64 
 
 
424 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  42.79 
 
 
433 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  44.25 
 
 
365 aa  269  6e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  44.51 
 
 
370 aa  268  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  43.36 
 
 
397 aa  239  5e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  42.59 
 
 
402 aa  229  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  42.96 
 
 
399 aa  222  8e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  45.08 
 
 
367 aa  216  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  36.32 
 
 
390 aa  202  1e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  35.92 
 
 
391 aa  184  2e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  34.57 
 
 
361 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  34.74 
 
 
378 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  32.2 
 
 
383 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  29 
 
 
404 aa  135  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  30.03 
 
 
394 aa  134  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  30.29 
 
 
395 aa  130  5e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  29.94 
 
 
368 aa  129  1e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  29.75 
 
 
451 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  32.46 
 
 
370 aa  124  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  26.43 
 
 
369 aa  122  2e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  1.20563e-05 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  25.83 
 
 
369 aa  120  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  29.83 
 
 
404 aa  120  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  27.92 
 
 
422 aa  118  2e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12333  integrase  49.28 
 
 
151 aa  116  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  25.94 
 
 
389 aa  116  8e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  25.56 
 
 
383 aa  115  1e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.32895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  27.35 
 
 
435 aa  115  1e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  26.41 
 
 
369 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  29.66 
 
 
387 aa  112  1e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  26.94 
 
 
373 aa  110  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  25.27 
 
 
374 aa  109  9e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3333  hypothetical protein  42.42 
 
 
182 aa  109  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.63 
 
 
390 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  26.93 
 
 
385 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.19227e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  29.13 
 
 
396 aa  108  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12675  phiRv2 prophage integrase  27.75 
 
 
375 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.14455e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  25.83 
 
 
392 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  3.97895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  26.85 
 
 
373 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  27.41 
 
 
368 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  27.94 
 
 
368 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  27.12 
 
 
388 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  31.62 
 
 
402 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  30.11 
 
 
414 aa  103  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  2.30336e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1985  phage integrase family protein  29.04 
 
 
469 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  24.43 
 
 
381 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.65595e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  30.03 
 
 
416 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2508  phage integrase family protein  26.53 
 
 
385 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  27.35 
 
 
400 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  27.75 
 
 
399 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  26.23 
 
 
357 aa  100  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1457  integrase family protein  29.56 
 
 
380 aa  99.8  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  25.6 
 
 
370 aa  99.8  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  24.03 
 
 
356 aa  99.8  8e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2767  integrase family protein  32.21 
 
 
453 aa  99.8  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  5.43052e-07  hitchhiker  0.000268456 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.22 
 
 
376 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.22 
 
 
376 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  27.07 
 
 
423 aa  98.6  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.885e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  29.81 
 
 
506 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  5.91844e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  25.91 
 
 
376 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.92232e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  27.68 
 
 
398 aa  97.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  25.53 
 
 
379 aa  97.8  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  24.59 
 
 
398 aa  96.7  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  31.64 
 
 
378 aa  95.5  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  27.38 
 
 
383 aa  95.5  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  24.04 
 
 
325 aa  95.5  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  34.13 
 
 
377 aa  94.4  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3899  phage integrase family protein  29.65 
 
 
379 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0795  integrase family protein  28.18 
 
 
401 aa  92  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  25.36 
 
 
386 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  28.08 
 
 
477 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  27.95 
 
 
379 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  27.37 
 
 
377 aa  91.3  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  27.95 
 
 
379 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  33.51 
 
 
295 aa  91.3  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  31.71 
 
 
402 aa  91.3  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.73566e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  24.57 
 
 
391 aa  90.9  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  25.4 
 
 
376 aa  90.9  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  26.01 
 
 
381 aa  90.5  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  27.33 
 
 
293 aa  90.1  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  26.81 
 
 
392 aa  89.7  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  26.23 
 
 
395 aa  89.4  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  21.71 
 
 
384 aa  89  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  26.75 
 
 
367 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  26.67 
 
 
293 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.69064e-10 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3390  phage integrase  27.71 
 
 
380 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  26.02 
 
 
380 aa  87  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  27.01 
 
 
454 aa  87  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  26.94 
 
 
463 aa  86.7  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  25.94 
 
 
378 aa  86.7  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  28.37 
 
 
381 aa  86.7  7e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  25.34 
 
 
381 aa  85.9  1e-15  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  27.24 
 
 
376 aa  85.9  1e-15  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  34.86 
 
 
451 aa  84.7  2e-15  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  27.74 
 
 
305 aa  84.3  3e-15  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  25.16 
 
 
387 aa  84  5e-15  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  24.32 
 
 
362 aa  84  5e-15  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  26.24 
 
 
300 aa  83.2  7e-15  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  31.91 
 
 
391 aa  83.2  8e-15  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  25.66 
 
 
357 aa  82.8  9e-15  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>