29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3043 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2997  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3043  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3012  hypothetical protein  99.62 
 
 
265 aa  531  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0438797  decreased coverage  0.00331074 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1837  hypothetical protein  55.77 
 
 
263 aa  296  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1275  hypothetical protein  25.42 
 
 
266 aa  101  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.298884  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2097  hypothetical protein  26.14 
 
 
267 aa  92.4  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.206136 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1030  hypothetical protein  26.47 
 
 
255 aa  89.7  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.275581  normal  0.132673 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  23.68 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1773  hypothetical protein  24.15 
 
 
267 aa  85.5  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.938201 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  25.38 
 
 
260 aa  77.8  2e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3211  putative integral membrane protein  24.38 
 
 
249 aa  74.3  2e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  0.0103033 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1721  hypothetical protein  28 
 
 
224 aa  73.6  3e-12  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00456561  normal  0.931616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5922  hypothetical protein  25.59 
 
 
252 aa  67.8  2e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235163  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0655  hypothetical protein  28.78 
 
 
264 aa  67  3e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.0929318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0666  hypothetical protein  28.78 
 
 
264 aa  66.6  4e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.0354499 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3512  hypothetical protein  26.62 
 
 
254 aa  63.9  2e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5841  hypothetical protein  27.36 
 
 
266 aa  63.9  3e-09  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3176  hypothetical protein  22 
 
 
260 aa  60.5  3e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.441176  hitchhiker  0.000145856 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6348  hypothetical protein  26.64 
 
 
253 aa  53.1  4e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.291018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3807  hypothetical protein  24.9 
 
 
254 aa  53.1  4e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18849  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0943  hypothetical protein  20.62 
 
 
260 aa  50.4  3e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0714  hypothetical protein  23.16 
 
 
270 aa  50.4  3e-05  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.570099  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0632  hypothetical protein  23.72 
 
 
279 aa  49.3  7e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2950  hypothetical protein  22.26 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0538  hypothetical protein  21.59 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86943  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0192  hypothetical protein  24.21 
 
 
267 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2455  hypothetical protein  26.45 
 
 
261 aa  45.8  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.928532  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0051  hypothetical protein  20.59 
 
 
252 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0992  hypothetical protein  22.81 
 
 
260 aa  43.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.489151  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>