78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2928 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_2928  GDSL family lipase  100 
 
 
256 aa  513  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2914  GDSL family lipase  100 
 
 
256 aa  513  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2884  lipolytic enzyme, G-D-S-L  99.61 
 
 
258 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0469503  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3183  GDSL family lipase  65.48 
 
 
256 aa  314  8e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  46.64 
 
 
270 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34730  lysophospholipase L1-like esterase  39.3 
 
 
302 aa  168  9e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0437206  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  41.73 
 
 
255 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  41.57 
 
 
300 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2206  lipolytic protein G-D-S-L family  38.93 
 
 
261 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.235445 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0855  hypothetical protein  39.03 
 
 
267 aa  159  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335493  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0386  lipolytic protein G-D-S-L family  36.86 
 
 
258 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0732  lipolytic protein G-D-S-L family  38.67 
 
 
263 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0023  GDSL family lipase  40 
 
 
259 aa  153  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0027  GDSL family lipase  38.74 
 
 
255 aa  151  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6531  hypothetical protein  37.88 
 
 
262 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.0269756 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1363  lipolytic protein G-D-S-L family  37.84 
 
 
289 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  39.15 
 
 
297 aa  149  5e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  37.55 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  37.45 
 
 
283 aa  146  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2954  lipolytic protein G-D-S-L family  40.32 
 
 
319 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1065  lipolytic protein G-D-S-L family  35.97 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1326  GDSL family lipase  36.29 
 
 
287 aa  138  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4413  GDSL family lipase  38.67 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  38.78 
 
 
260 aa  135  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0684  lipolytic protein G-D-S-L family  37.6 
 
 
273 aa  135  8e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0974788  hitchhiker  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1490  lipolytic protein G-D-S-L family  41.67 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3730  lipolytic protein G-D-S-L family  36.15 
 
 
281 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  35.04 
 
 
296 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0811  lipolytic protein G-D-S-L family  32.19 
 
 
333 aa  126  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.0157392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0731  lipolytic protein G-D-S-L family  34.9 
 
 
265 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2060  lipolytic protein G-D-S-L family  34.1 
 
 
281 aa  124  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0254  lipolytic protein G-D-S-L family  33.33 
 
 
254 aa  123  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0263  lipolytic protein G-D-S-L family  35.55 
 
 
301 aa  122  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2275  lipolytic protein G-D-S-L family  33.6 
 
 
278 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31650  lysophospholipase L1-like esterase  34.36 
 
 
326 aa  122  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3925  GDSL family lipase  35.92 
 
 
253 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2945  lipolytic protein G-D-S-L family  32.08 
 
 
289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3727  lipolytic protein G-D-S-L family  33.99 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3065  lipolytic protein G-D-S-L family  34.13 
 
 
262 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  35.18 
 
 
294 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23280  lysophospholipase L1-like esterase  31.09 
 
 
290 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.17 
 
 
270 aa  105  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5121  GDSL family lipase  32.45 
 
 
254 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245752  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  30.94 
 
 
196 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  29.83 
 
 
196 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21860  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  32.5 
 
 
307 aa  90.9  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00185801  normal  0.684974 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  29.28 
 
 
211 aa  90.5  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  28.73 
 
 
197 aa  89  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  28.73 
 
 
197 aa  89  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  28.8 
 
 
197 aa  89  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  28.73 
 
 
211 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  28.18 
 
 
197 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  28.18 
 
 
197 aa  86.3  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  31.75 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2667  GDSL family lipase  36.32 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24646  hitchhiker  0.000175501 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2484  GDSL family lipase  34.21 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3268  lipolytic protein G-D-S-L family  32.83 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2933  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.62 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  34.41 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2321  lipase/acylhydrolase  33.33 
 
 
143 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183981  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  35 
 
 
240 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  31.38 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0156  lipolytic protein G-D-S-L family  30.05 
 
 
256 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0132621  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3278  hypothetical protein  25.52 
 
 
229 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2237  GDSL family lipase  36.18 
 
 
284 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0161232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3955  GDSL family lipase  29.9 
 
 
218 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00727916  normal  0.035201 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0068  lipolytic protein  31.71 
 
 
247 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523857  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21100  lysophospholipase L1-like esterase  31.05 
 
 
223 aa  55.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2546  hypothetical protein  25.32 
 
 
239 aa  53.9  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.109536  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  31.71 
 
 
368 aa  52.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  36.17 
 
 
343 aa  52  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  28.36 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19520  lysophospholipase L1-like esterase  29.5 
 
 
209 aa  48.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.347124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1486  lipolytic protein G-D-S-L family  23.12 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.585939  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4904  Triacylglycerol lipase  26.7 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0762  lipolytic protein G-D-S-L family  30.77 
 
 
222 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3442  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.94 
 
 
232 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1589  lipolytic protein G-D-S-L family  25.24 
 
 
264 aa  42  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0691726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>