70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2923 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  100 
 
 
157 aa  308  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  100 
 
 
157 aa  308  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  100 
 
 
157 aa  308  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  74.51 
 
 
163 aa  228  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  73.55 
 
 
163 aa  226  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  65.33 
 
 
166 aa  201  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  63.09 
 
 
154 aa  192  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  61.81 
 
 
154 aa  169  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  55 
 
 
162 aa  166  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  55.26 
 
 
152 aa  166  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  54.9 
 
 
163 aa  165  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 
155 aa  164  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  57.79 
 
 
174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 
153 aa  160  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 
155 aa  160  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  55.41 
 
 
153 aa  159  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  55.48 
 
 
160 aa  156  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  49.67 
 
 
164 aa  153  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  53.1 
 
 
155 aa  151  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  54.67 
 
 
155 aa  150  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  50.33 
 
 
160 aa  149  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  53.33 
 
 
168 aa  149  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  54.19 
 
 
154 aa  148  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  52.32 
 
 
162 aa  147  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  48.05 
 
 
155 aa  142  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  52 
 
 
154 aa  141  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  50.3 
 
 
165 aa  135  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  52 
 
 
154 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  43.79 
 
 
154 aa  135  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  52.98 
 
 
156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  44.23 
 
 
172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  46.99 
 
 
166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  51.92 
 
 
154 aa  130  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  48.3 
 
 
154 aa  127  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  47.77 
 
 
324 aa  122  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  43.59 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  35 
 
 
157 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  35 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  35 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  47.83 
 
 
343 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  34.46 
 
 
229 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  28.83 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
289 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
324 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
167 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 
301 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 
333 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  31.17 
 
 
336 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  30.4 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  32 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  32 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  28.81 
 
 
150 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
302 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  33.33 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  33.33 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  33.33 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  27.63 
 
 
143 aa  42  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  33.33 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
156 aa  41.2  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  33.64 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 
326 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
139 aa  40.8  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  30.07 
 
 
305 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4360  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
153 aa  40.4  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11563  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.53 
 
 
346 aa  40.4  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>