More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2898 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2884  ABC transporter  53.41 
 
 
626 aa  636    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  82.05 
 
 
635 aa  1087    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  100 
 
 
634 aa  1277    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  99.69 
 
 
636 aa  1278    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  100 
 
 
636 aa  1282    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3164  ABC transporter  79.5 
 
 
637 aa  1018    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0211349  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11849  drug ABC transporter ATP-binding protein  61.93 
 
 
639 aa  792    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106158  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3409  ABC transporter  52.45 
 
 
633 aa  627  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.547153  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2853  ABC transporter related  50.07 
 
 
670 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453097  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2897  ABC transporter  50.07 
 
 
670 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3163  ABC transporter  52.06 
 
 
632 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705565  normal  0.189612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  45.01 
 
 
626 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  44.85 
 
 
615 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  45.17 
 
 
602 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  44.3 
 
 
606 aa  517  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  44.75 
 
 
605 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  42.99 
 
 
597 aa  500  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.65 
 
 
598 aa  498  1e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.61 
 
 
587 aa  375  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  36.61 
 
 
587 aa  375  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  35.51 
 
 
586 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  38.52 
 
 
704 aa  365  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  39.58 
 
 
708 aa  363  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  39.77 
 
 
713 aa  363  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  38.61 
 
 
704 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  35.16 
 
 
630 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  38.61 
 
 
712 aa  362  8e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  36.03 
 
 
596 aa  361  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  34.19 
 
 
588 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  35.19 
 
 
583 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  34.25 
 
 
712 aa  352  1e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  34.99 
 
 
613 aa  352  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  35.64 
 
 
595 aa  351  2e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  34.54 
 
 
579 aa  350  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  32.94 
 
 
590 aa  348  1e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  34.08 
 
 
578 aa  346  6e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  33.49 
 
 
701 aa  345  1e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  34.4 
 
 
610 aa  341  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  33.85 
 
 
575 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  35.82 
 
 
606 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  35.92 
 
 
621 aa  337  5.999999999999999e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  35.17 
 
 
593 aa  334  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  35.73 
 
 
614 aa  333  6e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  35.54 
 
 
614 aa  331  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  34.85 
 
 
596 aa  331  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  34.52 
 
 
588 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  32.18 
 
 
614 aa  324  4e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  37.59 
 
 
636 aa  323  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  33.83 
 
 
595 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  33.83 
 
 
563 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  34.59 
 
 
614 aa  316  8e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 
577 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  35.24 
 
 
599 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  32.95 
 
 
577 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  32.19 
 
 
589 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  34.15 
 
 
572 aa  302  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  30.64 
 
 
589 aa  300  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  31.3 
 
 
583 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  30.81 
 
 
589 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  30.81 
 
 
589 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  30.81 
 
 
589 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  31.57 
 
 
592 aa  296  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  30.86 
 
 
589 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  30.86 
 
 
589 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  30.85 
 
 
588 aa  293  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  30.46 
 
 
588 aa  289  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  30.46 
 
 
588 aa  289  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  30.46 
 
 
588 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.46 
 
 
588 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.46 
 
 
584 aa  289  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.46 
 
 
588 aa  289  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.46 
 
 
588 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  31.59 
 
 
651 aa  287  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1359  ABC transporter domain protein  32.42 
 
 
663 aa  283  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1330  ABC transporter domain protein  32.42 
 
 
663 aa  283  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1577  ABC transporter domain protein  33.1 
 
 
667 aa  283  9e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  hitchhiker  0.0000264384 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0045  ABC transporter related  33.67 
 
 
603 aa  280  6e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00741  ABC transporter, ATP binding protein  32 
 
 
660 aa  279  9e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0331  ABC transporter related  32.59 
 
 
534 aa  279  9e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0424  ABC transporter  31.6 
 
 
640 aa  278  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  29.27 
 
 
660 aa  276  7e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0762  ABC transporter domain protein  32.35 
 
 
557 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3991  ABC transporter related  29.75 
 
 
642 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03151  ABC transporter, ATP binding protein  32.05 
 
 
667 aa  273  8.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  29.18 
 
 
674 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3678  ABC transporter  35.53 
 
 
575 aa  270  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4887  ABC transporter domain protein  29.41 
 
 
589 aa  269  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00761  ABC transporter, ATP binding protein  30.92 
 
 
660 aa  267  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00771  ABC transporter, ATP binding protein  31.45 
 
 
660 aa  267  5e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209833  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0067  ABC transporter ATP-binding protein  31.64 
 
 
660 aa  266  7e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5296  ABC transporter domain protein  30.5 
 
 
567 aa  266  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  30.58 
 
 
591 aa  266  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0622  ATPase  30.4 
 
 
665 aa  265  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.333082  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1803  ABC transporter  33.88 
 
 
576 aa  265  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0999  ABC transporter domain protein  33.2 
 
 
557 aa  264  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0163  Sigma 54 interacting domain protein  29.42 
 
 
666 aa  264  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1645  ABC transporter related  30.72 
 
 
570 aa  264  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0414  ATPase  30.98 
 
 
668 aa  261  2e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3329  ABC transporter domain protein  33.68 
 
 
560 aa  261  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46957  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3826  ABC transporter related  34.7 
 
 
576 aa  259  7e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>