More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2800 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11905  integral membrane protein  59.38 
 
 
687 aa  739    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  54.03 
 
 
685 aa  662    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.98 
 
 
678 aa  679    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  78.21 
 
 
650 aa  1014    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  99.56 
 
 
682 aa  1337    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
682 aa  1342    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
682 aa  1342    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  77.39 
 
 
685 aa  1035    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.92 
 
 
697 aa  629  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.41 
 
 
666 aa  512  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.4 
 
 
680 aa  514  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  47.41 
 
 
666 aa  499  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.64 
 
 
676 aa  480  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.28 
 
 
672 aa  475  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.74 
 
 
558 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.770491 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.85 
 
 
539 aa  444  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.58 
 
 
525 aa  422  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.56 
 
 
528 aa  420  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.82 
 
 
554 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.4 
 
 
522 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.2 
 
 
569 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  44.72 
 
 
535 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.04 
 
 
504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.82 
 
 
504 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.82 
 
 
519 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.82 
 
 
504 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.82 
 
 
504 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.95 
 
 
528 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.82 
 
 
504 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.82 
 
 
504 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.02 
 
 
567 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.61 
 
 
504 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2560  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.83 
 
 
557 aa  396  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.577395  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.7 
 
 
504 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.06 
 
 
504 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.63 
 
 
509 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.46 
 
 
607 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.02 
 
 
501 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.63 
 
 
509 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.02 
 
 
509 aa  385  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.3 
 
 
504 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.63 
 
 
509 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.11 
 
 
538 aa  385  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00903391  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.85 
 
 
504 aa  382  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.47 
 
 
504 aa  378  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.51 
 
 
513 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4090  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.19 
 
 
523 aa  379  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.588022  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2111  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.44 
 
 
528 aa  378  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534364  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0662  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.34 
 
 
525 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2988  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.86 
 
 
514 aa  375  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23860  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.67 
 
 
572 aa  375  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0809765  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3357  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.04 
 
 
505 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299723 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  44.65 
 
 
520 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  0.00000000116602 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.27 
 
 
592 aa  373  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.852197 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.47 
 
 
592 aa  371  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.23 
 
 
530 aa  372  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.48 
 
 
526 aa  364  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0388  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.25 
 
 
532 aa  357  5e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.11 
 
 
641 aa  355  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.48 
 
 
516 aa  354  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2535  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.15 
 
 
575 aa  353  8e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.98 
 
 
535 aa  346  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.06 
 
 
519 aa  345  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.19 
 
 
555 aa  343  5.999999999999999e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.68 
 
 
541 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14720  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.97 
 
 
524 aa  337  2.9999999999999997e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.369508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5285  major facilitator superfamily MFS_1  37.74 
 
 
491 aa  336  9e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.98 
 
 
565 aa  336  9e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.19 
 
 
523 aa  333  7.000000000000001e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.67 
 
 
538 aa  332  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.39 
 
 
539 aa  331  3e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.72 
 
 
537 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  38.14 
 
 
537 aa  327  5e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  37.91 
 
 
537 aa  326  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  37.2 
 
 
537 aa  325  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.46 
 
 
554 aa  324  3e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  37.08 
 
 
537 aa  323  5e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.27 
 
 
537 aa  323  8e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.55 
 
 
538 aa  323  8e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.31 
 
 
685 aa  321  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00129972  normal  0.114111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.21 
 
 
593 aa  320  5e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  37.77 
 
 
537 aa  320  5e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  37.77 
 
 
537 aa  320  5e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  37.77 
 
 
537 aa  320  5e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4620  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.99 
 
 
566 aa  319  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226241  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3513  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.55 
 
 
850 aa  313  4.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.77 
 
 
562 aa  313  4.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  38.67 
 
 
476 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2674  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.31 
 
 
684 aa  312  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  36.86 
 
 
1062 aa  312  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.68 
 
 
561 aa  311  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011898  Ccel_0411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.21 
 
 
531 aa  309  9e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_23370  arabinose efflux permease family protein  37.7 
 
 
535 aa  309  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.517259  normal 
 
 
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NC_014211  Ndas_5486  major facilitator superfamily MFS_1  38.79 
 
 
584 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal 
 
 
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NC_012803  Mlut_01490  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.97 
 
 
624 aa  308  3e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_4211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.01 
 
 
491 aa  306  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  hitchhiker  0.00153857 
 
 
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NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.88 
 
 
534 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.84 
 
 
513 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.4 
 
 
621 aa  302  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_014158  Tpau_1011  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.22 
 
 
522 aa  302  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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