65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2752 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2738  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  447  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526378  normal  0.0730468 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2752  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  447  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2708  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  447  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.463816  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1248  hypothetical protein  56.28 
 
 
215 aa  230  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0560994  decreased coverage  0.00000150811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5553  hypothetical protein  54.84 
 
 
215 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.439561  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1051  hypothetical protein  42.46 
 
 
187 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0539048 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2648  beta-lactamase domain protein  34.36 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1978  hypothetical protein  36.54 
 
 
218 aa  62  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.628499  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2640  beta-lactamase domain protein  40.96 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 
217 aa  52.4  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3114  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 
217 aa  52  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  36.78 
 
 
206 aa  49.3  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 
208 aa  48.9  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0372  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
203 aa  48.9  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00504714  hitchhiker  0.000000000307388 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  40.74 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  37.11 
 
 
209 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15170  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  38.68 
 
 
226 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.112325 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4330  beta-lactamase domain-containing protein  31.67 
 
 
293 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  27.6 
 
 
207 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.65 
 
 
225 aa  46.2  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  33.1 
 
 
203 aa  46.2  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  38.78 
 
 
213 aa  45.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  40 
 
 
212 aa  45.4  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3439  Beta-lactamase-like  30.47 
 
 
228 aa  45.1  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.254177  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  31.95 
 
 
222 aa  45.1  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0560  beta-lactamase domain-containing protein  37.21 
 
 
267 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2264  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2406  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.36 
 
 
263 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000139632  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  47.5 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360479  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  34.74 
 
 
298 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  60 
 
 
214 aa  45.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0931  beta-lactamase domain-containing protein  34.51 
 
 
238 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0914  beta-lactamase-like protein  34.51 
 
 
238 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189009  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0362  beta-lactamase-like  33.68 
 
 
299 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000661224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0457  Beta-lactamase-like  33.68 
 
 
308 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  29.2 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1228  beta-lactamase domain-containing protein  33.94 
 
 
262 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0512718  normal  0.43815 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  26.72 
 
 
198 aa  43.5  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  26.47 
 
 
209 aa  43.5  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  40.85 
 
 
224 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2460  beta-lactamase-like  41.18 
 
 
191 aa  43.5  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4155  beta-lactamase domain-containing protein  29.06 
 
 
299 aa  43.5  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1819  beta-lactamase domain-containing protein  32.79 
 
 
204 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368429  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 
225 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 
225 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  31.06 
 
 
225 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0078  Beta-lactamase-like  30.61 
 
 
294 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15960  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.14 
 
 
269 aa  42.4  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.612617  hitchhiker  0.00000215477 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  43.86 
 
 
217 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 
202 aa  42.4  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  39.44 
 
 
214 aa  42.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  31.54 
 
 
221 aa  42.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10645  glyoxalase II  31.4 
 
 
237 aa  42.4  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.014491 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0646  Beta-lactamase-like  29.46 
 
 
298 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0369  beta-lactamase domain protein  33.68 
 
 
298 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0570  beta-lactamase domain-containing protein  34.72 
 
 
295 aa  42  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501842 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1778  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.63 
 
 
243 aa  42  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0392485  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43667  predicted protein  36.51 
 
 
890 aa  41.6  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2615  hypothetical protein  39.13 
 
 
106 aa  41.6  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0088  hypothetical protein  31.97 
 
 
240 aa  41.6  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.45541  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  31.4 
 
 
213 aa  41.6  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 
225 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1981  beta-lactamase domain-containing protein  36.92 
 
 
289 aa  41.6  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4261  beta-lactamase domain protein  33.08 
 
 
369 aa  41.6  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>