More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2663 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
290 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
290 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  98.97 
 
 
290 aa  570  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1180  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.89 
 
 
279 aa  281  8.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.26 
 
 
281 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.82 
 
 
279 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.36 
 
 
286 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 
303 aa  211  9e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 
286 aa  209  5e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.16 
 
 
282 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.12 
 
 
282 aa  206  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
292 aa  203  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
291 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
291 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
291 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
279 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
282 aa  201  8e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.26 
 
 
274 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 
296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.49 
 
 
293 aa  199  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
272 aa  199  6e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  43.08 
 
 
279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.58 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
291 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.01 
 
 
276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
278 aa  196  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 
293 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
276 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6770  short chain dehydrogenase  40.58 
 
 
276 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 
284 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  41.43 
 
 
280 aa  190  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  42.12 
 
 
274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6368  short chain dehydrogenase  45.52 
 
 
279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 
299 aa  188  7e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.64 
 
 
277 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 
284 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.88 
 
 
276 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.19 
 
 
280 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.32 
 
 
276 aa  186  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
286 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.54 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 
275 aa  183  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.14 
 
 
279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 
281 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  37.86 
 
 
282 aa  182  7e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.86 
 
 
275 aa  181  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  38.6 
 
 
278 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
279 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96036  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  40.93 
 
 
280 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
279 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 
273 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135056  normal  0.0706675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.16 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.64 
 
 
288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.99 
 
 
285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  41.57 
 
 
283 aa  179  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  38.55 
 
 
284 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
283 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  41.09 
 
 
280 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.77 
 
 
279 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  39.64 
 
 
276 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 
286 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 
274 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 
284 aa  176  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 
279 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  39.93 
 
 
279 aa  176  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 
274 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 
291 aa  175  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  38.52 
 
 
274 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.99 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  38.18 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  38.52 
 
 
274 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 
272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3237  short chain dehydrogenase  38.69 
 
 
274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.996911 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.29 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 
280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0057  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 
287 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.551816 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
296 aa  172  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
279 aa  172  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.2 
 
 
280 aa  172  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
287 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
285 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00800542  normal  0.26199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
278 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0773345 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08463  conserved hypothetical protein  38.68 
 
 
287 aa  170  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.796468 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 
292 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0160935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 
272 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
279 aa  170  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 
268 aa  169  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
277 aa  169  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  38.43 
 
 
285 aa  168  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02393  short chain oxidoreductase/dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01770)  41.04 
 
 
287 aa  167  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930439  normal  0.559669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3499  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 
294 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1825  short chain dehydrogenase  38.21 
 
 
278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356255  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.64 
 
 
281 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
283 aa  166  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>