More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2407 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  100 
 
 
400 aa  808    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 
400 aa  808    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  99.5 
 
 
400 aa  801    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  42.68 
 
 
403 aa  281  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  45.01 
 
 
393 aa  279  5e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  44.63 
 
 
407 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  42.78 
 
 
371 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  40.75 
 
 
397 aa  266  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  42.17 
 
 
399 aa  265  8e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  42.4 
 
 
374 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  42.08 
 
 
372 aa  251  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  42.86 
 
 
400 aa  250  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  40.15 
 
 
402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  39.5 
 
 
402 aa  243  6e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  38.96 
 
 
398 aa  238  9e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  37.88 
 
 
424 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  40.62 
 
 
398 aa  237  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  37 
 
 
403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  41.6 
 
 
404 aa  233  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  38.44 
 
 
380 aa  233  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  37.44 
 
 
400 aa  226  7e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  40.45 
 
 
424 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  42.21 
 
 
387 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  39.84 
 
 
393 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  37 
 
 
467 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  37.47 
 
 
402 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  37.01 
 
 
423 aa  219  5e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  38.16 
 
 
400 aa  219  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  34.68 
 
 
372 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  40.48 
 
 
371 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  36.95 
 
 
408 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  35.32 
 
 
415 aa  208  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  35.08 
 
 
370 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  37.53 
 
 
415 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  39.78 
 
 
396 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  33.79 
 
 
384 aa  193  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  33.43 
 
 
390 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  36.57 
 
 
388 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  34.17 
 
 
351 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  38.82 
 
 
411 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  35.09 
 
 
377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  35.17 
 
 
391 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  36.1 
 
 
389 aa  178  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  33.51 
 
 
418 aa  159  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  32.58 
 
 
394 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  33.93 
 
 
388 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  30.93 
 
 
396 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  33.05 
 
 
381 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  32.89 
 
 
386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  30.21 
 
 
496 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 
413 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  30.72 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  30.81 
 
 
373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  30.43 
 
 
388 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  31.14 
 
 
405 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  33.89 
 
 
434 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  35.08 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  30.27 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  32.58 
 
 
396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  30.79 
 
 
393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.97 
 
 
387 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  29.23 
 
 
377 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2149  monooxygenase FAD-binding protein  23.89 
 
 
391 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.438269  normal  0.289576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  25.96 
 
 
376 aa  90.5  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  28.31 
 
 
410 aa  90.9  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  27.45 
 
 
396 aa  90.1  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  28.17 
 
 
374 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  29.34 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  28.41 
 
 
399 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  27.51 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  26.55 
 
 
374 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  26.44 
 
 
404 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  23.46 
 
 
368 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  26.06 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  26.63 
 
 
376 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  25.14 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  25.07 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  24.87 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  29.15 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  29.3 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  23.18 
 
 
368 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09700  putative monooxygenase  30.32 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000279069  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  29.52 
 
 
378 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  26.38 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  27.3 
 
 
402 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  24.5 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  25.4 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0904  putative monooxygenase  30.38 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  25.8 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  25.43 
 
 
403 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5376  hypothetical protein  26.65 
 
 
438 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  22.35 
 
 
369 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  25.5 
 
 
386 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  26.98 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  22.45 
 
 
369 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  24.78 
 
 
404 aa  72  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  26.74 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  27.75 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  28.45 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  25.51 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>