173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2309 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_12120  predicted acetamidase/formamidase  77.4 
 
 		 418 aa  667    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181447  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2262  formamidase  100 
 
 		 417 aa  850    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5199  Formamidase  82.69 
 
 		 417 aa  695    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2309  formamidase  100 
 
 		 417 aa  850    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2301  formamidase  99.76 
 
 		 417 aa  848    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.506693 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0076  Formamidase  85.37 
 
 		 418 aa  721    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1721  Formamidase  85.37 
 
 		 418 aa  714    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787514  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2158  Formamidase  82.49 
 
 		 417 aa  696    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.062604  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  71.81 
 
 		 414 aa  626  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0422  Formamidase  65.12 
 
 		 415 aa  559  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2658  formamidase  60.63 
 
 		 416 aa  507  9.999999999999999e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  59.25 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3110  Formamidase  57.42 
 
 		 408 aa  483  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1777  formamidase  57.28 
 
 		 406 aa  475  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00161545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0569  formamidase  56.49 
 
 		 410 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0981  formamidase  57.35 
 
 		 410 aa  476  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.068454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  55.77 
 
 		 410 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  56.01 
 
 		 410 aa  472  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  59.11 
 
 		 411 aa  473  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0179  formamidase  55.77 
 
 		 410 aa  472  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0225  formamidase  55.99 
 
 		 409 aa  468  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3737  formamidase  55.53 
 
 		 412 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4631  formamidase  55.53 
 
 		 412 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3592  formamidase  56.73 
 
 		 409 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5673  formamidase  55.77 
 
 		 412 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4073  formamidase  54.7 
 
 		 410 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398995  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1448  Formamidase  56.3 
 
 		 409 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  55.67 
 
 		 409 aa  455  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3140  Formamidase  56.25 
 
 		 410 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  55.05 
 
 		 409 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3375  formamidase  55.05 
 
 		 409 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2970  formamidase  55.07 
 
 		 410 aa  449  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3566  Formamidase  55.29 
 
 		 409 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3569  formamidase  55.16 
 
 		 408 aa  443  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  55.05 
 
 		 409 aa  441  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0659  formamidase (formamide amidohydrolase)  55.56 
 
 		 409 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.386066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1257  formamidase  56.79 
 
 		 409 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66975  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2157  Formamidase  54.03 
 
 		 420 aa  434  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174868  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54476  formidase  51.9 
 
 		 451 aa  434  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.185862  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3859  formamidase  56.01 
 
 		 409 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28914  formamidase  50.5 
 
 		 426 aa  397  1e-109  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0986635 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2285  Acetamidase/Formamidase  48.42 
 
 		 423 aa  393  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.117842 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04577  FormamidasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.49); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C453]  49.38 
 
 		 411 aa  385  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  46.02 
 
 		 401 aa  318  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2612  formamidase  51.18 
 
 		 206 aa  210  3e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0583639  normal  0.408367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  34.86 
 
 		 393 aa  189  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  34.77 
 
 		 388 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  32.31 
 
 		 459 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  31.22 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  30.26 
 
 		 322 aa  152  8e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  28.99 
 
 		 328 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  29.07 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  29.07 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  29.03 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  29.07 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  27.08 
 
 		 313 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  28.49 
 
 		 312 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3454  formamidase  32.07 
 
 		 224 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172386  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  26.67 
 
 		 315 aa  99.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  26.9 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  26.67 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  24.8 
 
 		 314 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  30.49 
 
 		 491 aa  79.7  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  28.08 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37719  formamidase-like protein  29.69 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990726  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  32.74 
 
 		 481 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  33.49 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  32.21 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  27.24 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  28.83 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  29.6 
 
 		 485 aa  75.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  27.24 
 
 		 438 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  27.24 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  27.66 
 
 		 358 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  30.87 
 
 		 479 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  30.47 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  28.46 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  29.6 
 
 		 479 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  27.95 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  30.26 
 
 		 791 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  26.69 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  25.38 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  27.15 
 
 		 313 aa  69.7  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  24.31 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  28.7 
 
 		 483 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  26.54 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  25.5 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  27.99 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  30.69 
 
 		 343 aa  67  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  28.21 
 
 		 454 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  25.79 
 
 		 484 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  31.03 
 
 		 359 aa  66.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  28.46 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  26.09 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  28.52 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  28.1 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  31.68 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 791 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  27.18 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  28.07 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>