53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2155 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_2155  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  299  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2109  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  299  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2896  hypothetical protein  62.16 
 
 
151 aa  189  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2324  hypothetical protein  64.43 
 
 
153 aa  187  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2174  multimeric flavodoxin WrbA  56.38 
 
 
150 aa  172  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05610  hypothetical protein  56.67 
 
 
150 aa  168  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1931  hypothetical protein  56.38 
 
 
150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1758  hypothetical protein  53.33 
 
 
151 aa  161  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12784  hypothetical protein  54.36 
 
 
150 aa  161  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2376  hypothetical protein  55.7 
 
 
151 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.444871  normal  0.0454888 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0321  hypothetical protein  57.45 
 
 
157 aa  159  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4011  hypothetical protein  54.36 
 
 
151 aa  159  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  decreased coverage  0.00529167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2093  NADPH-dependent FMN reductase  55.03 
 
 
150 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5173  hypothetical protein  54.67 
 
 
152 aa  154  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20060  hypothetical protein  50.31 
 
 
165 aa  141  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3354  multimeric flavodoxin WrbA  51.18 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0792608  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2081  multimeric flavodoxin WrbA  45.27 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2300  hypothetical protein  51.35 
 
 
146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1398  hypothetical protein  48.32 
 
 
153 aa  123  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792672  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2210  flavodoxin  45.52 
 
 
154 aa  107  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.129224  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2092  hypothetical protein  87.1 
 
 
78 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0956237 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0567  hypothetical protein  39.46 
 
 
154 aa  101  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.765091  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7733  oxidoreductase  43.33 
 
 
163 aa  100  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0557  hypothetical protein  39.31 
 
 
154 aa  100  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6157  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.67 
 
 
193 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295986  normal  0.101429 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1429  hypothetical protein  36.49 
 
 
153 aa  94  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6187  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.33 
 
 
163 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246576  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5822  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.33 
 
 
163 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6006  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.33 
 
 
163 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.768135  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5761  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.5 
 
 
163 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.643418  normal  0.673071 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6666  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.5 
 
 
163 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4330  flavodoxin/nitric oxide synthase  44 
 
 
165 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  0.0216763 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4220  flavodoxin/nitric oxide synthase  44 
 
 
165 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681573  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2895  hypothetical protein  50.62 
 
 
82 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3330  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.6 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.252914 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0648  hypothetical protein  37.93 
 
 
154 aa  82  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2331  hypothetical protein  47.5 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.85 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.144164 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3490  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  40.94 
 
 
163 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572882  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2016  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.99 
 
 
166 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2272  hypothetical protein  41.76 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0129429  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2335  hypothetical protein  52.17 
 
 
71 aa  73.6  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478676  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2762  hypothetical protein  35.9 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.929868  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2190  hypothetical protein  47.89 
 
 
86 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.465011  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2493  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.15 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000345605 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3017  multimeric flavodoxin WrbA  42.68 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  32 
 
 
168 aa  45.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1414  hypothetical protein  29.66 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201843  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  27.34 
 
 
200 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  27.34 
 
 
200 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.33 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0631  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.36 
 
 
212 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  24.19 
 
 
199 aa  40  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>