More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2133 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2087  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 140 aa  280  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183046  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2070  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 140 aa  280  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00505229  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2133  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 140 aa  280  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0098213 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0631  MerR family transcriptional regulator  66.91 
 
 		 158 aa  186  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.170706 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4691  MerR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6164  transcriptional regulator, MerR family  41.35 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5849  putative transcriptional regulator  38.52 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00369897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3271  transcriptional regulator, MerR family  31.4 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0868413 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3152  MerR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.335124  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5793  transcriptional regulator, MerR family  37.01 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2129  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.802398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1029  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  33.33 
 
 		 161 aa  62  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3541  MerR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4022  MerR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605309  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4462  MerR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5668  transcriptional regulator, MerR family  32.39 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0423  MerR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 140 aa  60.1  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2311  transcriptional regulator, MerR family  35.04 
 
 		 135 aa  60.1  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113317  normal  0.278177 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0734  regulatory protein, MerR  34.4 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.308445  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.26 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01184  Transcriptional regulator, MerR family protein  31.9 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2818  transcriptional regulator, MerR family  31.03 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000370461  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1546  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.548833  normal  0.109608 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67550  putative transcriptional regulator  34.43 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0955895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 391 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2579  MerR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136218  normal  0.025304 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3389  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879982 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4236  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4130  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal  0.465162 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0546  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.45 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0563  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.45 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0607  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.45 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.45 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2489  putative transcriptional regulator, MerR family  31.53 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00633728 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06555  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  30.63 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3920  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4260  MerR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 141 aa  57  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.49412 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2837  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0963  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.26 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0738  transcriptional regulator, MerR family  32.43 
 
 		 160 aa  57  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  38.3 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000675  redox-sensitive transcriptional activator soxR  30.63 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3642  transcriptional regulator, MerR family  30.63 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  30.12 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1565  transcriptional regulator, MerR family protein  30.08 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  37.8 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  32.58 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00438  DNA-binding transcriptional activator of copper-responsive regulon genes  31.45 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3123  transcriptional regulator, MerR family  31.45 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.856714  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 390 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1905  MerR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.380273  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1990  transcriptional regulator, MerR family  33.05 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3837  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265561  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0566  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.45 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0586  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.45 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.775911 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0422  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.45 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0526  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.45 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0530  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.45 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000248  transcriptional regulator  30.28 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00443  hypothetical protein  31.45 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3129  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.45 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.943376  hitchhiker  0.0000753695 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03935  DNA-binding transcriptional dual regulator, Fe-S center for redox-sensing  32.41 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.015828  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3929  transcriptional regulator, MerR family  32.41 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4305  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.41 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4273  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3964  MerR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0321214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  33.9 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0267  MerR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2683  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.903809  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2902  regulatory protein, MerR  31.9 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4616  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.41 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0033  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.696294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4581  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.41 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  35.35 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4525  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.41 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 319 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03895  hypothetical protein  32.41 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0184757  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5566  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.41 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.953635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2276  MerR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101998  hitchhiker  0.00000024461 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2694  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3269  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1858  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15558  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0035  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0035  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02196  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.17 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3972  MerR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4525  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  31.48 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4661  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  31.48 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4517  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  31.48 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3931  transcriptional regulator, MerR family  42.37 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4611  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  31.48 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0111034  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4610  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  31.48 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.327282 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  27.56 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3072  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 341 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1099  transcriptional regulator, MerR family  29.66 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>