182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2045 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1999  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 504 aa  997    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0525134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2045  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 504 aa  997    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2217  amino acid permease-associated region  90.34 
 
 		 503 aa  910    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291041 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1980  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 504 aa  997    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4126  amino acid permease-associated region  88.76 
 
 		 502 aa  885    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.635081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  25.66 
 
 		 500 aa  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 464 aa  114  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2961  amino acid permease-associated region  26.49 
 
 		 481 aa  113  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.408205 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0671  amino acid permease-associated region  25.39 
 
 		 500 aa  109  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  hitchhiker  0.0000196904 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 		 474 aa  101  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2190  amino acid permease-associated region  24.87 
 
 		 497 aa  97.1  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  22.26 
 
 		 455 aa  94  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  25.26 
 
 		 473 aa  92  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1536  amino acid transporter  24.56 
 
 		 476 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0652543  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  24.6 
 
 		 475 aa  88.6  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  26.85 
 
 		 469 aa  84.3  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  24.21 
 
 		 472 aa  83.6  0.000000000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  24.15 
 
 		 466 aa  83.2  0.000000000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0388  putative amino acid permease  26.1 
 
 		 467 aa  82.8  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  24.32 
 
 		 508 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  25.25 
 
 		 495 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2105  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  26.14 
 
 		 511 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.902861  normal  0.230296 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  26.14 
 
 		 511 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  26.14 
 
 		 511 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  26.14 
 
 		 511 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  26.14 
 
 		 511 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01463  hypothetical protein  26.14 
 
 		 511 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  26.14 
 
 		 511 aa  76.6  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2165  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  26.14 
 
 		 511 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0669643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  26.14 
 
 		 511 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  22.82 
 
 		 475 aa  74.3  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  21.95 
 
 		 464 aa  73.6  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  21.84 
 
 		 464 aa  72.8  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4375  amino acid permease-associated region  22.79 
 
 		 495 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0552  glutamate/GABA antiporter  24.55 
 
 		 506 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  23.06 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  23.06 
 
 		 470 aa  71.2  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2031  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  22.1 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  23.34 
 
 		 467 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63480  putative amino acid permease  25.23 
 
 		 465 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.982931 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  24.02 
 
 		 494 aa  69.3  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  23.59 
 
 		 467 aa  68.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1412  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  25.58 
 
 		 503 aa  68.6  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0796975  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  23 
 
 		 474 aa  68.6  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3825  glutamate/gamma-aminobutyrate anti-porter  24.26 
 
 		 506 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  23.4 
 
 		 474 aa  67.4  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2317  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter family protein  21.87 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1507  glutamate:gamma-aminobutyrate antiporter family protein  22.37 
 
 		 485 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  25.07 
 
 		 446 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  26.53 
 
 		 486 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  24.86 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  24.45 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1297  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  21.92 
 
 		 485 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00362427  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  20.37 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  20.37 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 494 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  21.94 
 
 		 486 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  20.37 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  22.82 
 
 		 443 aa  56.2  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  20.37 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  21.94 
 
 		 486 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  21.94 
 
 		 486 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  20.37 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  23.74 
 
 		 454 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  22.93 
 
 		 499 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  22.48 
 
 		 505 aa  55.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1492  amino acid permease-associated region  23.12 
 
 		 431 aa  55.1  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.993916  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  22.78 
 
 		 480 aa  54.7  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156631 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1529  amino acid permease-associated region  24.37 
 
 		 473 aa  53.9  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327796  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6300  amino acid permease-associated region  24.37 
 
 		 473 aa  53.9  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.819384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  21.97 
 
 		 455 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6959  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 		 473 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1671  arginine/ornithine antiporter  22.95 
 
 		 475 aa  53.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  23.27 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  23.27 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  23.27 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  23.27 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  23.27 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  22.74 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  23.75 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  22.74 
 
 		 471 aa  52  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0009  amino acid permease-associated region  29.1 
 
 		 474 aa  52  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0059  amino acid permease-associated region  23.77 
 
 		 493 aa  52  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2101  arginine/ornithine antiporter  23.17 
 
 		 475 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0476819  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  26.97 
 
 		 452 aa  52  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2908  UspA domain protein  27.12 
 
 		 636 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.1088  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0883  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  20.43 
 
 		 511 aa  51.2  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  26.6 
 
 		 456 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  22.28 
 
 		 446 aa  50.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 		 462 aa  50.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  25.17 
 
 		 464 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 		 462 aa  50.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 		 462 aa  50.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 463 aa  50.1  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1335  amino acid permease-associated region  22.13 
 
 		 430 aa  50.1  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.654483 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0976  amino acid transporter  24.38 
 
 		 470 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046598 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  23.12 
 
 		 471 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  25.55 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2418  amino acid permease-associated region  25.62 
 
 		 444 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112494  normal  0.0680601 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>