65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2009 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  293  6e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  293  6e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  283  8e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  85.42 
 
 
152 aa  259  8e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  75.89 
 
 
141 aa  225  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  70.83 
 
 
147 aa  224  4e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  57.45 
 
 
150 aa  173  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1557  hypothetical protein  55.88 
 
 
137 aa  165  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  53.68 
 
 
146 aa  154  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  51.82 
 
 
153 aa  147  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  46.21 
 
 
146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3220  hypothetical protein  42.96 
 
 
143 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  33.83 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  35.61 
 
 
146 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  38.58 
 
 
140 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  38.58 
 
 
140 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  38.58 
 
 
140 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2209  hypothetical protein  34.65 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  38.35 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  37.8 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  32.39 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  32.12 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  33.85 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0753  hypothetical protein  28.77 
 
 
167 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  33.87 
 
 
135 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  33.87 
 
 
135 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  33.87 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  35.71 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  33.09 
 
 
156 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3538  hypothetical protein  33.87 
 
 
144 aa  55.1  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  29.37 
 
 
190 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3815  hypothetical protein  30.58 
 
 
138 aa  52.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  33.85 
 
 
156 aa  52  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  28.8 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2029  hypothetical protein  28.87 
 
 
168 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  25.58 
 
 
156 aa  50.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3527  hypothetical protein  31.2 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  26.56 
 
 
179 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  30.65 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3762  hypothetical protein  28.91 
 
 
148 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503533  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1490  hypothetical protein  25.56 
 
 
148 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3823  hypothetical protein  28.91 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190466  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3750  hypothetical protein  28.91 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  28.46 
 
 
450 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10315  hypothetical protein  24.83 
 
 
163 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.793118 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  30.08 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4199  hypothetical protein  27.86 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272235  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3701  hypothetical protein  27.5 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.713261  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1179  hypothetical protein  26.98 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4216  hypothetical protein  30.83 
 
 
145 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.435307  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1152  hypothetical protein  26.19 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2436  hypothetical protein  28.46 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.774863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4856  hypothetical protein  28.24 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0599762  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1169  hypothetical protein  26.19 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0302  hypothetical protein  27.82 
 
 
163 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029098  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3181  hypothetical protein  30.22 
 
 
186 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.14179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  24 
 
 
181 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  26.61 
 
 
166 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5042  hypothetical protein  27.94 
 
 
189 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.723187  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3809  hypothetical protein  29.17 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4109  hypothetical protein  27.74 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0968  hypothetical protein  30.53 
 
 
162 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0459119  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2758  hypothetical protein  23.66 
 
 
170 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.232937 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  26.19 
 
 
145 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>