More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1959 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  99.76 
 
 
409 aa  810    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  100 
 
 
409 aa  814    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  100 
 
 
409 aa  814    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  38.21 
 
 
459 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  35.87 
 
 
440 aa  194  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  35.93 
 
 
426 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  35.61 
 
 
430 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  35.97 
 
 
407 aa  190  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  34.59 
 
 
416 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  35.54 
 
 
438 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  32.92 
 
 
426 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  34.07 
 
 
445 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  36.36 
 
 
432 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  33.49 
 
 
407 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  35.05 
 
 
423 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  35.28 
 
 
412 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  35.17 
 
 
411 aa  179  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  34.41 
 
 
421 aa  179  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  34.89 
 
 
417 aa  178  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  34.35 
 
 
411 aa  177  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  33.17 
 
 
407 aa  176  6e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  34.15 
 
 
455 aa  176  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  34.77 
 
 
429 aa  176  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  33.02 
 
 
445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  35.58 
 
 
413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  35.52 
 
 
420 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  33.01 
 
 
419 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  33.57 
 
 
411 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  34.47 
 
 
411 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  37.59 
 
 
414 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  33.9 
 
 
433 aa  172  7.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  36.25 
 
 
411 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  34.06 
 
 
433 aa  169  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  35.8 
 
 
414 aa  170  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  29.38 
 
 
413 aa  169  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  33.01 
 
 
486 aa  169  7e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  35.38 
 
 
433 aa  169  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  33.67 
 
 
431 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  36.87 
 
 
402 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  31.9 
 
 
413 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  34.2 
 
 
428 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  35.51 
 
 
413 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  31.96 
 
 
443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  34.52 
 
 
408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  34.52 
 
 
408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  34.52 
 
 
408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  33.41 
 
 
461 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  33.73 
 
 
413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  32.27 
 
 
419 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  33.73 
 
 
413 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  38.17 
 
 
419 aa  163  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  35.99 
 
 
461 aa  162  7e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  34.13 
 
 
434 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  36.04 
 
 
417 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  36.04 
 
 
417 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  36.04 
 
 
417 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  35.28 
 
 
412 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  36.04 
 
 
424 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  35.53 
 
 
421 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  32.85 
 
 
482 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  34.29 
 
 
425 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  35.81 
 
 
402 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  32.53 
 
 
437 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  37.23 
 
 
422 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  32.78 
 
 
423 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  35.96 
 
 
425 aa  159  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  33.42 
 
 
436 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  31.68 
 
 
431 aa  158  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  32.93 
 
 
405 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  31.64 
 
 
426 aa  157  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  33.42 
 
 
391 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  31.18 
 
 
444 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  33.01 
 
 
434 aa  155  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  34.06 
 
 
444 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  33.09 
 
 
421 aa  153  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  30.44 
 
 
401 aa  152  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  33.93 
 
 
403 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  32.77 
 
 
418 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  31.28 
 
 
433 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  30.73 
 
 
400 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  33.69 
 
 
430 aa  150  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  33.5 
 
 
428 aa  149  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  33.42 
 
 
407 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  33.57 
 
 
404 aa  149  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  32.03 
 
 
408 aa  149  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  31.59 
 
 
441 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  32.08 
 
 
426 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  34.72 
 
 
426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  32.13 
 
 
470 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  31.25 
 
 
407 aa  146  5e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  30.62 
 
 
436 aa  146  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  31.28 
 
 
429 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  31.78 
 
 
405 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  30.71 
 
 
444 aa  146  8.000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  28.54 
 
 
412 aa  145  9e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  30.05 
 
 
426 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  34.95 
 
 
403 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  35.11 
 
 
409 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  32.48 
 
 
415 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  30.29 
 
 
478 aa  143  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>