More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1915 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1869  methyltransferase type 11  100 
 
 
259 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1915  methyltransferase type 11  100 
 
 
259 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.107391  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  99.23 
 
 
259 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  78.49 
 
 
261 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  77.1 
 
 
263 aa  400  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  74.19 
 
 
274 aa  354  6.999999999999999e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  66.14 
 
 
264 aa  332  3e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  66.12 
 
 
248 aa  324  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  67.48 
 
 
248 aa  316  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  59.46 
 
 
258 aa  263  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4654  Methyltransferase type 11  34.09 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.302301  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  45.75 
 
 
1106 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  37.89 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4218  methyltransferase type 11  41.04 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
1032 aa  82.8  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  36.05 
 
 
634 aa  81.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  35.34 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.05 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  28.14 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  34.97 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1483  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
885 aa  68.2  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  34.35 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  32.17 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  34.1 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  35.17 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  34.1 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  35.46 
 
 
870 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  40.86 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  35.92 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2175  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.300294  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.14 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  39.22 
 
 
309 aa  65.1  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  37.62 
 
 
239 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.07 
 
 
255 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  37 
 
 
239 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  39.58 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  34.27 
 
 
239 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5676  hypothetical protein  27.33 
 
 
272 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34 
 
 
345 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2514  methyltransferase type 11  28.21 
 
 
359 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.775917 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  30.34 
 
 
244 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  39.64 
 
 
233 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  33.67 
 
 
253 aa  62.4  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0298  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.79 
 
 
254 aa  62  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  30.99 
 
 
246 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  38.38 
 
 
331 aa  61.6  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 
255 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  36.73 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.06 
 
 
230 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  39.78 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.22 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6865  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 
282 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  36.52 
 
 
354 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
208 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  30.25 
 
 
244 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
237 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
711 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0658  Methyltransferase type 11  30 
 
 
233 aa  60.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
252 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204476  normal  0.816598 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  39.78 
 
 
254 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  29.33 
 
 
810 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  35.48 
 
 
266 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2143  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.35 
 
 
272 aa  59.7  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.136766  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
266 aa  60.1  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.16 
 
 
241 aa  60.1  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.6 
 
 
265 aa  59.7  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  36.19 
 
 
279 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  25.61 
 
 
292 aa  59.3  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  34.62 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4394  Methyltransferase type 11  29.34 
 
 
192 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  30.81 
 
 
442 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  36.44 
 
 
347 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  40.2 
 
 
263 aa  58.9  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  30.87 
 
 
210 aa  58.9  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 
242 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 
242 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  29.9 
 
 
257 aa  58.5  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3819  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.33 
 
 
248 aa  58.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
250 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  34.29 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
284 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  32.62 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3574  methyltransferase type 11  34.31 
 
 
235 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 
276 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  29.22 
 
 
1635 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  30.3 
 
 
400 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.24 
 
 
272 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.38 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4499  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  29.01 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000152328 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1083  hypothetical protein  26.8 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  32.65 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  31.79 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00659  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- benzoquinol methylase  29.91 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  29.79 
 
 
232 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  30 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  28.67 
 
 
401 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
286 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.06 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>