More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1873 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  90.08 
 
 		 393 aa  737    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  99.75 
 
 		 393 aa  806    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 393 aa  809    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 393 aa  809    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  91.35 
 
 		 393 aa  744    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  36.51 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  33.96 
 
 		 424 aa  206  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  34.77 
 
 		 423 aa  203  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  36.05 
 
 		 434 aa  202  7e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  35.9 
 
 		 423 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  36.24 
 
 		 445 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  32.19 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  34.04 
 
 		 423 aa  193  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  35.16 
 
 		 431 aa  193  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  36.09 
 
 		 440 aa  193  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  33.88 
 
 		 435 aa  192  9e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  31.76 
 
 		 434 aa  189  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  30.81 
 
 		 431 aa  189  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  35.77 
 
 		 443 aa  189  9e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  35.04 
 
 		 419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  35.32 
 
 		 444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  34.23 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  37.54 
 
 		 413 aa  171  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  32.3 
 
 		 431 aa  170  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  31.68 
 
 		 430 aa  169  9e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  32.27 
 
 		 443 aa  168  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  30.75 
 
 		 426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  31.71 
 
 		 430 aa  164  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  31.25 
 
 		 424 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  33.43 
 
 		 436 aa  154  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  32.09 
 
 		 398 aa  150  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  35.6 
 
 		 409 aa  149  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  29.95 
 
 		 384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  30.65 
 
 		 466 aa  143  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  34.99 
 
 		 406 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  34.99 
 
 		 406 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  33.76 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  34.93 
 
 		 408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  29.9 
 
 		 398 aa  139  7e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5254  geranylgeranyl reductase  34.02 
 
 		 416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  33.43 
 
 		 409 aa  133  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  34.49 
 
 		 418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  32.71 
 
 		 403 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  31.48 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  31.06 
 
 		 435 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0948  geranylgeranyl reductase  30.79 
 
 		 417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  30.29 
 
 		 415 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  30.48 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  27.71 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  31.97 
 
 		 420 aa  111  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  30.89 
 
 		 406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  25.57 
 
 		 414 aa  109  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  27.67 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  28.75 
 
 		 376 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 		 409 aa  106  8e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  31.23 
 
 		 400 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  29.79 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 		 414 aa  103  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  29.63 
 
 		 384 aa  102  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  27.99 
 
 		 420 aa  102  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  30.94 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 411 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  27.06 
 
 		 408 aa  100  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 413 aa  99.4  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 		 390 aa  99  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0808  geranylgeranyl reductase  30.95 
 
 		 406 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  hitchhiker  0.000310699 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  27.51 
 
 		 362 aa  97.1  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 		 410 aa  96.7  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 410 aa  94.7  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  26.99 
 
 		 385 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  28.99 
 
 		 368 aa  94  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  25 
 
 		 376 aa  93.2  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.46 
 
 		 389 aa  93.2  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  31.52 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0862  geranylgeranyl reductase  29.35 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  27.71 
 
 		 383 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  28.69 
 
 		 399 aa  92  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  27.49 
 
 		 368 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  25.13 
 
 		 390 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  26.86 
 
 		 387 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  26.26 
 
 		 390 aa  90.9  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  29.59 
 
 		 384 aa  90.5  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  29.08 
 
 		 423 aa  90.5  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  27.19 
 
 		 399 aa  89.4  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  26.82 
 
 		 376 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  25.78 
 
 		 376 aa  87.4  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  24.87 
 
 		 375 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  29.03 
 
 		 379 aa  87.4  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  27.19 
 
 		 403 aa  86.7  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  25.48 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  27.54 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05221  NAD binding site  27.93 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  25.7 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  35.26 
 
 		 478 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  25.52 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  26.07 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  28.45 
 
 		 394 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  28.45 
 
 		 394 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  25.43 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>