More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1846 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 
520 aa  1008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13079  ATP-dependent DNA ligase  73.32 
 
 
507 aa  662  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 
520 aa  1008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 
520 aa  1008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  77.78 
 
 
534 aa  754  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  77.25 
 
 
511 aa  752  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  61.15 
 
 
509 aa  566  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  60.38 
 
 
508 aa  560  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  57.33 
 
 
513 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  56.76 
 
 
513 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  57.38 
 
 
522 aa  488  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  57.84 
 
 
527 aa  490  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2845  ATP-dependent DNA ligase  58.69 
 
 
509 aa  487  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  55.81 
 
 
503 aa  475  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0272  ATP-dependent DNA ligase  57.98 
 
 
512 aa  474  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000560558  hitchhiker  0.000258657 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  59.35 
 
 
592 aa  462  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0096  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  52.76 
 
 
506 aa  459  1e-128  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0228406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  56.19 
 
 
513 aa  460  1e-128  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  53.15 
 
 
510 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  53.55 
 
 
539 aa  442  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  51.92 
 
 
507 aa  444  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.84866e-07 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4301  ATP-dependent DNA ligase  57.44 
 
 
519 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0719  ATP-dependent DNA ligase  53.27 
 
 
537 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4586  ATP-dependent DNA ligase  49.9 
 
 
517 aa  392  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  37.26 
 
 
567 aa  295  2e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  36.46 
 
 
568 aa  274  4e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  35.08 
 
 
531 aa  273  6e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  37.64 
 
 
552 aa  268  2e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4933  ATP dependent DNA ligase  49.85 
 
 
442 aa  266  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  37.53 
 
 
553 aa  239  9e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  37.58 
 
 
592 aa  234  2e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.82 
 
 
562 aa  231  2e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  35.55 
 
 
610 aa  225  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  35.28 
 
 
556 aa  222  2e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  34 
 
 
546 aa  219  1e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.83 
 
 
601 aa  210  4e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.47 
 
 
573 aa  210  6e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.26 
 
 
550 aa  209  9e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.82 
 
 
573 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.47 
 
 
573 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  35.14 
 
 
576 aa  208  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  30.21 
 
 
603 aa  208  2e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  37.93 
 
 
548 aa  204  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.35 
 
 
594 aa  204  4e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.27 
 
 
1017 aa  202  2e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  32.55 
 
 
584 aa  199  1e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  31.77 
 
 
584 aa  196  1e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  33.85 
 
 
547 aa  195  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  32.76 
 
 
584 aa  192  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.28 
 
 
573 aa  189  9e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  31.91 
 
 
583 aa  189  1e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0750  ATP-dependent DNA ligase  31.15 
 
 
601 aa  188  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  28.78 
 
 
549 aa  186  9e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.33 
 
 
590 aa  186  1e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.51 
 
 
582 aa  185  1e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  28.99 
 
 
598 aa  184  4e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.27 
 
 
588 aa  174  2e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.09 
 
 
583 aa  169  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  29.61 
 
 
803 aa  162  1e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2960  ATP-dependent DNA ligase  29.89 
 
 
535 aa  142  1e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  7.5537e-05 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56005  predicted protein  27.03 
 
 
719 aa  140  8e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.410085 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2667  ATP-dependent DNA ligase  30.36 
 
 
532 aa  139  9e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2589  ATP-dependent DNA ligase  28.87 
 
 
534 aa  135  2e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00328254 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1076  ATP-dependent DNA ligase  29.15 
 
 
533 aa  135  2e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1462  ATP-dependent DNA ligase  31.07 
 
 
551 aa  135  2e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0685513 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16988  predicted protein  28.6 
 
 
664 aa  135  2e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606353  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6857  ATP dependent DNA ligase  27.46 
 
 
530 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.924337  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2413  ATP-dependent DNA ligase  28.78 
 
 
533 aa  134  4e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1569  ATP-dependent DNA ligase  28.23 
 
 
532 aa  133  8e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_51005  predicted protein  28.38 
 
 
651 aa  133  9e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01736  ATP-dependent DNA ligase  29.82 
 
 
534 aa  131  4e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07831  ATP-dependent DNA ligase  22.73 
 
 
546 aa  129  9e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08591  ATP-dependent DNA ligase  23.43 
 
 
545 aa  129  1e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.267229  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0290  ATP-dependent DNA ligase  33.33 
 
 
550 aa  129  1e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1040  ATP-dependent DNA ligase  26.94 
 
 
554 aa  126  7e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.081093  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2562  ATP dependent DNA ligase  25.55 
 
 
535 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06069  DNA ligase (Eurofung)  25.45 
 
 
932 aa  124  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07831  ATP-dependent DNA ligase  22.51 
 
 
546 aa  123  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.555428  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02270  DNA ligase  26.71 
 
 
530 aa  122  1e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05480  DNA ligase, putative  25.16 
 
 
944 aa  120  4e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3524  ATP-dependent DNA ligase  27.79 
 
 
538 aa  120  5e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.755693 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  35.69 
 
 
847 aa  120  8e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3895  ATP-dependent DNA ligase  29.22 
 
 
551 aa  119  1e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3449  ATP dependent DNA ligase  29.55 
 
 
544 aa  119  1e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.422145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3334  ATP dependent DNA ligase  26.37 
 
 
532 aa  119  1e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1583  ATP dependent DNA ligase  27.84 
 
 
552 aa  119  2e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0733  ATP-dependent DNA ligase  22.6 
 
 
546 aa  119  2e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1755  ATP dependent DNA ligase  25 
 
 
533 aa  118  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3691  ATP dependent DNA ligase  34.55 
 
 
572 aa  116  8e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1611  ATP dependent DNA ligase  33.75 
 
 
522 aa  116  9e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04883  DNA ligase (Eurofung)  24.6 
 
 
816 aa  116  1e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.125619 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4859  ATP-dependent DNA ligase  29.65 
 
 
551 aa  115  1e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425556  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3135  ATP dependent DNA ligase  29.5 
 
 
584 aa  114  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.519108  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1518  ATP-dependent DNA ligase  32.51 
 
 
542 aa  112  1e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.111157  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0798  ATP-dependent DNA ligase  32.63 
 
 
648 aa  112  2e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109452  normal  0.0163574 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4680  ATP-dependent DNA ligase  28.99 
 
 
561 aa  112  2e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.137791 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0412  ATP dependent DNA ligase  33.91 
 
 
514 aa  112  2e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.900501  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1315  ATP-dependent DNA ligase  30.77 
 
 
558 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693977  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3432  ATP dependent DNA ligase  32.09 
 
 
576 aa  110  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0304262  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3979  ATP-dependent DNA ligase  34.38 
 
 
532 aa  110  9e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379965  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>