More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1807 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1741  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00122783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1760  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298302  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1807  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  72.97 
 
 		 222 aa  327  6e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4366  GntR family transcriptional regulator  72.85 
 
 		 222 aa  320  9.000000000000001e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4638  transcriptional regulator, GntR family  49.06 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4360  transcriptional regulator, GntR family  42.79 
 
 		 226 aa  141  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0104  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 251 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.99437  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0114  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 231 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0123  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 251 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  normal  0.0318508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0130  GntR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 228 aa  132  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3134  regulatory protein GntR HTH  37.22 
 
 		 238 aa  128  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0715  regulatory protein GntR, HTH  35.85 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10166  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 264 aa  118  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1495  regulatory protein GntR HTH  38.74 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  30.91 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34.34 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 214 aa  97.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  33.81 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  32.39 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.45 
 
 		 223 aa  92.8  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 227 aa  90.9  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 233 aa  89.7  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 211 aa  89.4  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 227 aa  88.6  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  34.47 
 
 		 222 aa  88.6  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  34.26 
 
 		 233 aa  86.3  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 237 aa  86.3  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 233 aa  86.3  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  28.26 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 229 aa  85.9  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3493  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 270 aa  85.1  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.671641 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0606  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0179  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 214 aa  84.7  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 235 aa  84.7  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  26.96 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  31.92 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.23 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4602  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3549  transcriptional regulator  29.44 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3655  transcriptional regulator  29.44 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3620  transcriptional regulator  29.44 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0556349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3548  transcriptional regulator  29.44 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3717  transcriptional regulator  29.44 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  0.297823 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  29.38 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1439  transcriptional regulator, GntR family  27.03 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  31.79 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0010  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  hitchhiker  0.00449189 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1888  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  32.54 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2806  GntR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 241 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2293  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235113  hitchhiker  0.00231289 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3023  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>