More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1796 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4376  hypothetical protein  56.06 
 
 		 710 aa  714    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11385  hypothetical protein  56.93 
 
 		 715 aa  736    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1749  hypothetical protein  100 
 
 		 709 aa  1382    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13421  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5243  hypothetical protein  52.1 
 
 		 730 aa  645    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1796  hypothetical protein  100 
 
 		 709 aa  1382    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284537  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1968  hypothetical protein  61.01 
 
 		 726 aa  796    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1730  hypothetical protein  100 
 
 		 709 aa  1382    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0204  hypothetical protein  47.35 
 
 		 711 aa  481  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0026  hypothetical protein  42.03 
 
 		 817 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2389  hypothetical protein  33.38 
 
 		 762 aa  365  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280266  normal  0.917371 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2794  hypothetical protein  31.35 
 
 		 770 aa  362  2e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0547661  normal  0.0162252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1528  hypothetical protein  32.56 
 
 		 771 aa  362  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.983664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.22 
 
 		 371 aa  263  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0566  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50 
 
 		 674 aa  260  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297383  normal  0.30294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1081  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.39 
 
 		 370 aa  156  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  27.45 
 
 		 679 aa  142  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1183  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.79 
 
 		 387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  30.12 
 
 		 351 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1006 aa  94  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3075  hypothetical protein  25.24 
 
 		 989 aa  87.4  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.697159  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3305  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.85 
 
 		 274 aa  75.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1623  hypothetical protein  35.92 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.240534  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0692  hypothetical protein  28.73 
 
 		 968 aa  73.9  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2122  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.38 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0389221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2046  hypothetical protein  29.93 
 
 		 290 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000420492  hitchhiker  0.0000188727 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1525  hypothetical protein  29.82 
 
 		 287 aa  70.1  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0151  hypothetical protein  38.21 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  32.54 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0113  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  27.56 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0522  HesA/MoeB/ThiF family protein  41.27 
 
 		 267 aa  65.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1067  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.08 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.451189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3716  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.59 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2212  thiF family protein  29.33 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  32.54 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1190  thiamine biosynthesis protein ThiF  31.54 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2396  hypothetical protein  32.39 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000837429  normal  0.548926 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1702  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.51 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00338443  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3150  ThiF family protein  30.38 
 
 		 268 aa  63.9  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1994  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  34.33 
 
 		 672 aa  62.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.9 
 
 		 242 aa  63.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1107  adenylyltransferase thiF  34.07 
 
 		 260 aa  62.8  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3213  ThiF family protein  29.75 
 
 		 268 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1350  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.97 
 
 		 284 aa  62  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3313  ThiF family protein  29.75 
 
 		 268 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.223246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0546  HesA/MoeB/ThiF family protein  32.57 
 
 		 277 aa  62.4  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0491251  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2248  HesA/MoeB/ThiF family protein  27.88 
 
 		 240 aa  62  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1848  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0735  thiamine biosynthesis protein ThiF  31.54 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0890  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.81 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.86 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3133  ThiF family protein  29.75 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.852277  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3199  ThiF family protein  29.75 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.04 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315425  normal  0.241342 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.75 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.47369 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2423  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.81 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1624  molybdopterin biosynthesis protein MoeY  27.45 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00849574  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002691  HesA/MoeB/ThiF family protein  32 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0777  thiamine biosynthesis protein ThiF  28.41 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.21058 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3058  ThiF family protein  30.38 
 
 		 268 aa  60.1  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0969752  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1666  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.77 
 
 		 378 aa  60.1  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28085  normal  0.198345 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0191  hypothetical protein  32.87 
 
 		 291 aa  60.1  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.409062  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2935  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.25 
 
 		 282 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2953  ThiF family protein  30.38 
 
 		 266 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0973303  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02663  hypothetical protein  30.38 
 
 		 268 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0876  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.38 
 
 		 268 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0591  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.51 
 
 		 266 aa  59.3  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.266567  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2956  ThiF family protein  30.38 
 
 		 268 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00132  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02624  hypothetical protein  30.38 
 
 		 268 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0374  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30 
 
 		 684 aa  59.7  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04809  molybdopterin biosynthesis protein  37.17 
 
 		 276 aa  60.1  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3118  ThiF family protein  30.38 
 
 		 268 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00141325  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2502  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.44 
 
 		 292 aa  59.7  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.435247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1157  thiamine biosynthesis protein ThiF  29.38 
 
 		 215 aa  59.3  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0900  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.38 
 
 		 268 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.49 
 
 		 254 aa  59.7  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813417  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.52 
 
 		 253 aa  58.9  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3522  molybdopterin and thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing enzyme  33.33 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03292  hypothetical protein  31.33 
 
 		 269 aa  58.9  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0215  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35.94 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0516175 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2591  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.91 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5899  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.91 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30.67 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1238  4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate synthesis protein ThiF  30.5 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1043  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  35.25 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000044291  hitchhiker  0.000000000393673 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1956  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.72 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3958  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2567  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.72 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450041  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.6 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251146  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0085  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.72 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1898  HesA/MoeB/ThiF family protein  32.14 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1178  thiamine biosynthesis protein ThiF  34.71 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5267  molybdopterin and thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing enzyme  31.54 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0797  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32 
 
 		 265 aa  56.6  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  27.22 
 
 		 343 aa  57  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0360  HesA/MoeB/ThiF family protein  34.12 
 
 		 288 aa  57.4  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00356091  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold-containing protein  33.96 
 
 		 302 aa  57  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2477  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.66 
 
 		 338 aa  57  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.509569 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0108  HesA/MoeB/ThiF family protein  34.12 
 
 		 288 aa  57.4  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00087346  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  28.26 
 
 		 335 aa  57  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0905  HesA/MoeB/ThiF family protein  34.12 
 
 		 288 aa  57.4  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386795  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0660  HesA/MoeB/ThiF family protein  34.12 
 
 		 288 aa  57.4  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0996044  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2495  HesA/MoeB/ThiF family protein  34.12 
 
 		 288 aa  57.4  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>