28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1760 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1714  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.754442  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1760  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1691  hypothetical protein  96.73 
 
 
245 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.148884  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5545  hypothetical protein  58.19 
 
 
253 aa  263  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.458717  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3437  hypothetical protein  55.32 
 
 
245 aa  245  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0606758 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3426  hypothetical protein  55.32 
 
 
245 aa  245  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3489  hypothetical protein  55.32 
 
 
245 aa  245  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.28663 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19980  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR02206  55.84 
 
 
234 aa  223  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00940514  hitchhiker  0.00120115 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22330  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR02206  36.73 
 
 
284 aa  122  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4483  putative ABC transporter, permease protein  30 
 
 
244 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0252052 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0711  hypothetical protein  30.91 
 
 
244 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0853  putative ABC transporter, permease protein  29.57 
 
 
249 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0963  putative ABC transporter, permease protein  29.09 
 
 
244 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0710  permease  29.55 
 
 
244 aa  105  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.251527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0800  ABC transporter permease  29.09 
 
 
244 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.93303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0891  ABC transporter, permease protein, putative  29.09 
 
 
244 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.220032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0761  ABC transporter permease  29.09 
 
 
244 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0895  putative ABC transporter, permease protein  29.09 
 
 
244 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.41872e-39 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0696  permease  29.09 
 
 
244 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0158  hypothetical protein  30.52 
 
 
259 aa  94  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3061  hypothetical protein  38.28 
 
 
235 aa  85.1  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.485598 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1968  hypothetical protein  30.48 
 
 
239 aa  79  0.00000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0736708  hitchhiker  0.000925089 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0686  hypothetical protein  32.96 
 
 
253 aa  77  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0198  hypothetical protein  28.33 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.485643  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1952  hypothetical protein  28 
 
 
234 aa  58.5  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.523935  normal  0.0461591 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0812  hypothetical protein  23.88 
 
 
284 aa  55.8  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000113907  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0824  hypothetical protein  22.49 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000195088  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0089  hypothetical protein  22.97 
 
 
225 aa  48.5  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0669519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>