94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1619 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  374  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 188 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  96.81 
 
 		 192 aa  338  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  59.04 
 
 		 187 aa  221  7e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 187 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  40 
 
 		 191 aa  111  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  30.68 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  29.58 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  33.12 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 179 aa  72  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  35.12 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  25.13 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000584066  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 187 aa  62  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  26.37 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4190  hypothetical protein  34.64 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3138  TetR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.293904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  33.98 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  34.55 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  34.55 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  34.55 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3310  hypothetical protein  27.66 
 
 		 212 aa  51.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.106528 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 212 aa  51.6  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 223 aa  48.9  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 188 aa  48.5  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 210 aa  47.8  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3415  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3680  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5723  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00322286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  27.14 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0583  regulatory protein, TetR  34.78 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 224 aa  42.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 212 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 212 aa  42  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 		 189 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0020  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 246 aa  42  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.390674  normal  0.0209926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5881  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 197 aa  42  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  31.43 
 
 		 209 aa  42  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 213 aa  41.6  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 212 aa  41.6  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 221 aa  41.6  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3816  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0181155  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 194 aa  41.6  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1058  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 207 aa  41.2  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 211 aa  41.2  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 220 aa  41.2  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>