More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1599 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13171  NADH dehydrogenase I chain F nuoF (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain F)  82.76 
 
 		 445 aa  749    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7686  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  76.05 
 
 		 441 aa  671    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0286  NADH-quinone oxidoreductase subunit F  73.78 
 
 		 428 aa  660    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1545  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  99.32 
 
 		 438 aa  887    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.349481  normal  0.139293 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5058  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  70.53 
 
 		 439 aa  637    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  73.55 
 
 		 428 aa  656    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1575  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  100 
 
 		 438 aa  891    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  79.24 
 
 		 706 aa  698    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4486  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  88.58 
 
 		 438 aa  764    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144316  hitchhiker  0.0024852 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  72.41 
 
 		 433 aa  666    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  73.96 
 
 		 434 aa  666    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1599  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  100 
 
 		 438 aa  891    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1880  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  89.32 
 
 		 441 aa  770    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0474  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  70.21 
 
 		 448 aa  634  1e-180  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  70.84 
 
 		 438 aa  630  1e-179  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0525  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  71.16 
 
 		 440 aa  630  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  71.53 
 
 		 443 aa  617  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3173  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.25 
 
 		 446 aa  613  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2711  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  72.06 
 
 		 444 aa  613  9.999999999999999e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6677  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  72.09 
 
 		 431 aa  613  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  70.32 
 
 		 424 aa  609  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  69.57 
 
 		 448 aa  608  1e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07430  NADH dehydrogenase subunit F  70.14 
 
 		 449 aa  610  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0432719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  69.59 
 
 		 447 aa  599  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4553  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  69.45 
 
 		 442 aa  596  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3224  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  69.57 
 
 		 439 aa  592  1e-168  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4458  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.79 
 
 		 443 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4060  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.07 
 
 		 443 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.306589 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0979  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.42 
 
 		 439 aa  554  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1279  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  61.87 
 
 		 438 aa  549  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.01 
 
 		 421 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.63 
 
 		 434 aa  451  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.99 
 
 		 427 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.99 
 
 		 427 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.16 
 
 		 426 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.3 
 
 		 426 aa  426  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0914  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.11 
 
 		 446 aa  427  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4083  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.53 
 
 		 446 aa  425  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.323862  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.53 
 
 		 422 aa  424  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.07 
 
 		 449 aa  422  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  52.25 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3630  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.39 
 
 		 424 aa  421  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.35 
 
 		 441 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.548898  normal  0.181766 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.05 
 
 		 441 aa  418  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.05 
 
 		 441 aa  418  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.05 
 
 		 441 aa  418  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.06 
 
 		 425 aa  418  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.43 
 
 		 427 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  51.5 
 
 		 428 aa  415  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1154  NADH dehydrogenase (quinone)  50.36 
 
 		 436 aa  415  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.36 
 
 		 451 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4077  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.08 
 
 		 454 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1316  NADH dehydrogenase I subunit F  51.01 
 
 		 433 aa  413  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132795  normal  0.0201547 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50 
 
 		 429 aa  413  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1305  NADH dehydrogenase I subunit F  52 
 
 		 430 aa  414  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3221  NADH dehydrogenase I subunit F  51.76 
 
 		 429 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.37 
 
 		 425 aa  411  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.08 
 
 		 444 aa  411  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  49.52 
 
 		 425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  49.52 
 
 		 425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  50.84 
 
 		 438 aa  408  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.76 
 
 		 456 aa  405  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1377  NADH dehydrogenase I chain F  49.3 
 
 		 448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0721979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2243  NADH dehydrogenase I subunit F  50.63 
 
 		 431 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0486512  normal  0.115108 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1718  NADH dehydrogenase I subunit F  50.5 
 
 		 434 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0894  NADH dehydrogenase I subunit F  51.67 
 
 		 434 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1560  NADH dehydrogenase I subunit F  51.5 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1925  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.53 
 
 		 445 aa  399  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0748  NADH dehydrogenase I subunit F  50.5 
 
 		 432 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1027  NADH dehydrogenase I subunit F  52.44 
 
 		 434 aa  399  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.38 
 
 		 425 aa  399  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1265  NADH dehydrogenase I subunit F  49.62 
 
 		 434 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1812  NADH dehydrogenase I subunit F  48.44 
 
 		 461 aa  398  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.848425 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1564  NADH dehydrogenase I subunit F  48.44 
 
 		 461 aa  398  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  47.78 
 
 		 422 aa  396  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1458  NADH dehydrogenase I subunit F  48.44 
 
 		 461 aa  398  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0486  NADH dehydrogenase I subunit F  49.62 
 
 		 427 aa  395  1e-109  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1882  NADH dehydrogenase I subunit F  49.5 
 
 		 441 aa  395  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2518  NADH dehydrogenase I subunit F  51.32 
 
 		 431 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3304  NADH dehydrogenase I subunit F  47.96 
 
 		 450 aa  398  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0360562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0926  NADH dehydrogenase I subunit F  51.64 
 
 		 431 aa  395  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1066  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.89 
 
 		 436 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0842517  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  47.78 
 
 		 422 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1179  NADH dehydrogenase I subunit F  49.75 
 
 		 431 aa  395  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.049393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0783  NADH dehydrogenase I subunit F  52.27 
 
 		 435 aa  396  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.860034  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4556  NADH dehydrogenase I subunit F  50 
 
 		 441 aa  398  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1311  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.7 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3333  NADH dehydrogenase I subunit F  50 
 
 		 441 aa  398  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240845  normal  0.194232 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1180  NADH dehydrogenase I subunit F  51.32 
 
 		 431 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258408  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1357  NADH dehydrogenase I subunit F  49.87 
 
 		 434 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0732  NADH dehydrogenase I, F subunit  47.74 
 
 		 436 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2660  NADH dehydrogenase I subunit F  46.97 
 
 		 445 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.142172  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1824  NADH dehydrogenase I, F subunit  47.74 
 
 		 436 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  48.47 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1440  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.89 
 
 		 436 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0584655  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1295  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.89 
 
 		 436 aa  395  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2161  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.89 
 
 		 440 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1017  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.29 
 
 		 425 aa  392  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4395  NADH dehydrogenase I subunit F  51.26 
 
 		 433 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1498  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.6 
 
 		 458 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>