More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1577 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_1577  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
333 aa  648    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1523  alcohol dehydrogenase  98.8 
 
 
333 aa  640    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0659671  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1554  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
333 aa  648    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439452  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4503  alcohol dehydrogenase  81.17 
 
 
324 aa  521  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1864  alcohol dehydrogenase  80.56 
 
 
324 aa  520  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15133  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13162  NADPH quinone oxidoreductase fadB4  73.68 
 
 
323 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2364  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  67.18 
 
 
321 aa  368  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180992  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  61.73 
 
 
322 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1382  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.26 
 
 
324 aa  352  5.9999999999999994e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4894  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.8 
 
 
323 aa  328  6e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4574  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.93 
 
 
331 aa  308  9e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.750038  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1858  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.02 
 
 
320 aa  281  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0130  alcohol dehydrogenase  55.38 
 
 
320 aa  271  8.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0082  alcohol dehydrogenase  50.93 
 
 
321 aa  265  8e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0092  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.93 
 
 
321 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0101  alcohol dehydrogenase  50.93 
 
 
321 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0992812 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0740  alcohol dehydrogenase  48.91 
 
 
320 aa  253  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0107  alcohol dehydrogenase  47.66 
 
 
322 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.21 
 
 
322 aa  226  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  41.72 
 
 
325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  42.47 
 
 
333 aa  224  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  43.75 
 
 
325 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.81 
 
 
325 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.06 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  41.9 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  43.77 
 
 
326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  41.9 
 
 
325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  43.16 
 
 
324 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  44.58 
 
 
323 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.98 
 
 
324 aa  211  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.36 
 
 
324 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  40.67 
 
 
325 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10150  quinone oxidoreductase  45.51 
 
 
322 aa  210  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  40.67 
 
 
325 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  40.67 
 
 
325 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.67 
 
 
325 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.46 
 
 
326 aa  207  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0870  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.48 
 
 
319 aa  205  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  41.87 
 
 
337 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  41.98 
 
 
324 aa  203  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  41.85 
 
 
326 aa  202  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  41.27 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.34 
 
 
327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  40.74 
 
 
324 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.92 
 
 
326 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2132  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.82 
 
 
331 aa  193  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2114  alcohol dehydrogenase  42.28 
 
 
324 aa  192  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  39.81 
 
 
326 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.96 
 
 
324 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  44.24 
 
 
326 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  41.23 
 
 
331 aa  188  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 
323 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.12 
 
 
324 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1259  alcohol dehydrogenase  43.61 
 
 
326 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.51 
 
 
324 aa  186  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  43.26 
 
 
326 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2119  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.88 
 
 
361 aa  185  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428078  normal  0.0987257 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  39.2 
 
 
319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.3 
 
 
326 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  43.3 
 
 
326 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.02 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0644  alcohol dehydrogenase  44.82 
 
 
331 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.815744 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.61 
 
 
335 aa  183  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1203  oxidoreductase protein  39.51 
 
 
324 aa  182  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1960  alcohol dehydrogenase  41.72 
 
 
326 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.480335 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.27 
 
 
324 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.27 
 
 
324 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  38.34 
 
 
324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0037  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.04 
 
 
324 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1047  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.34 
 
 
324 aa  179  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510115  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.94 
 
 
324 aa  178  9e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.34 
 
 
324 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0470349  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1906  alcohol dehydrogenase  39.7 
 
 
340 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466553  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.51 
 
 
319 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.96 
 
 
322 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  37.35 
 
 
324 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  37.85 
 
 
327 aa  177  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  37.04 
 
 
324 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1667  alcohol dehydrogenase  40.92 
 
 
329 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.367647  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0707  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.73 
 
 
324 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2354  putative NADPH quinone oxidoreductase, zinc- containing  39.38 
 
 
324 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350138  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1855  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.15 
 
 
329 aa  172  5.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.61 
 
 
326 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0714054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5263  putative oxidoreductase  41.54 
 
 
325 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4830  alcohol dehydrogenase  39.82 
 
 
332 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.17 
 
 
328 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.49 
 
 
324 aa  169  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.81 
 
 
325 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00555058  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1389  alcohol dehydrogenase  37.23 
 
 
322 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.86 
 
 
328 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4130  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.69 
 
 
313 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  34.86 
 
 
328 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5243  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.46 
 
 
329 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244024  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  40.4 
 
 
324 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.15 
 
 
324 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.191683 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3207  alcohol dehydrogenase  39.01 
 
 
324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.56 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.55 
 
 
325 aa  166  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2194  quinone oxidoreductase  33.94 
 
 
328 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0247156  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  34.56 
 
 
328 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>