More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1453 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  100 
 
 
361 aa  717    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  100 
 
 
361 aa  717    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  69.23 
 
 
363 aa  420  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  73.71 
 
 
363 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  61.63 
 
 
363 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  62.07 
 
 
348 aa  361  9e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  61.49 
 
 
348 aa  358  9e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  61.78 
 
 
348 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  60.57 
 
 
348 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  60.33 
 
 
370 aa  353  4e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  53.82 
 
 
372 aa  325  9e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  53.82 
 
 
372 aa  325  9e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  53.54 
 
 
372 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  51.07 
 
 
378 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  50.55 
 
 
393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  41.95 
 
 
378 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  38.87 
 
 
347 aa  200  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  40 
 
 
348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  33.85 
 
 
332 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  33.86 
 
 
340 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  31.95 
 
 
330 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  29.09 
 
 
343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  52.17 
 
 
232 aa  131  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  32.02 
 
 
366 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  50.89 
 
 
227 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  32.23 
 
 
446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  56.12 
 
 
164 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  27.94 
 
 
321 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5355  hypothetical protein  43.57 
 
 
365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5444  hypothetical protein  43.57 
 
 
365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  31.94 
 
 
335 aa  113  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  52 
 
 
350 aa  113  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  29.07 
 
 
342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5734  hypothetical protein  43.78 
 
 
365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5924  hypothetical protein  46.04 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  27.43 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  54.64 
 
 
380 aa  109  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  28.44 
 
 
350 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  30.77 
 
 
327 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  29.6 
 
 
306 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.59 
 
 
235 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0505  hypothetical protein  47.45 
 
 
364 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  28.41 
 
 
334 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  42.31 
 
 
331 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  41.82 
 
 
173 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  43.27 
 
 
452 aa  99.8  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  29.02 
 
 
319 aa  97.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  40.71 
 
 
340 aa  97.8  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.9 
 
 
438 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  42.72 
 
 
417 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  40.91 
 
 
333 aa  96.7  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  44.23 
 
 
459 aa  96.3  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  27.84 
 
 
348 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  48.54 
 
 
323 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  44.55 
 
 
400 aa  93.2  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  31.25 
 
 
394 aa  92.8  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  41.51 
 
 
432 aa  92.8  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  41.51 
 
 
432 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  24.77 
 
 
337 aa  92.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  46.23 
 
 
298 aa  91.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  40 
 
 
333 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44.92 
 
 
393 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  39.81 
 
 
388 aa  90.5  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  41.12 
 
 
349 aa  90.1  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  40.95 
 
 
281 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  27.25 
 
 
330 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  45.19 
 
 
225 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  43.88 
 
 
373 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  38.28 
 
 
224 aa  89  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  45.19 
 
 
226 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  39.8 
 
 
162 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  40.71 
 
 
389 aa  87.8  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  37.5 
 
 
224 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  42.11 
 
 
291 aa  87.8  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  42.7 
 
 
293 aa  87  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  39.47 
 
 
223 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  39.47 
 
 
223 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  39.47 
 
 
223 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  41.94 
 
 
265 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  39.84 
 
 
222 aa  86.7  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  34.62 
 
 
173 aa  86.3  7e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  40.95 
 
 
317 aa  86.3  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  41.41 
 
 
217 aa  86.3  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1816  NLP/P60 protein  36.36 
 
 
859 aa  85.9  9e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  42.42 
 
 
398 aa  85.9  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  38.52 
 
 
223 aa  85.9  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  38.52 
 
 
223 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  39.45 
 
 
453 aa  85.5  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  40.91 
 
 
391 aa  85.5  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  41.75 
 
 
160 aa  85.9  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  36.36 
 
 
234 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  36.36 
 
 
234 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  44.21 
 
 
236 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.06 
 
 
531 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  38.6 
 
 
234 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  41.07 
 
 
368 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  41.49 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  36.36 
 
 
234 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  38.6 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  38.6 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>