More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1218 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  75.08 
 
 
869 aa  1247    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  49.19 
 
 
851 aa  702    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  100 
 
 
866 aa  1736    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  46.97 
 
 
848 aa  676    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  74.18 
 
 
863 aa  1276    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  99.08 
 
 
866 aa  1721    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  100 
 
 
866 aa  1736    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  75.26 
 
 
861 aa  1252    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.72 
 
 
838 aa  469  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  35.19 
 
 
851 aa  464  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  40.69 
 
 
777 aa  448  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5286  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  41.1 
 
 
933 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135201  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3181  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  41.32 
 
 
849 aa  437  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  41.02 
 
 
856 aa  437  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.92 
 
 
910 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  38.95 
 
 
895 aa  425  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  38.56 
 
 
1108 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6416  ABC transporter related  39.17 
 
 
702 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00507697  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.71 
 
 
863 aa  318  4e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4431  FHA domain-containing protein  29.39 
 
 
796 aa  313  5.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  29.34 
 
 
1004 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.44 
 
 
890 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.33 
 
 
903 aa  284  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  28.76 
 
 
799 aa  281  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  30.05 
 
 
799 aa  280  8e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2932  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  29.98 
 
 
802 aa  280  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  40.6 
 
 
878 aa  256  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  30.34 
 
 
770 aa  256  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  39.23 
 
 
899 aa  239  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6943  ABC transporter related  30.32 
 
 
972 aa  219  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.144831 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0963  ABC transporter related  27.83 
 
 
590 aa  162  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13396  hypothetical protein  64.6 
 
 
122 aa  153  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0921482 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49726  predicted protein  27.38 
 
 
741 aa  140  7e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25217  predicted protein  26.6 
 
 
635 aa  140  7e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  33.8 
 
 
282 aa  130  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50096  predicted protein  27.76 
 
 
640 aa  130  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_23497  predicted protein  32.11 
 
 
1891 aa  128  5e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2001  ABC transporter related  34.65 
 
 
258 aa  127  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3313  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.22 
 
 
502 aa  127  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571004  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42103  ABC(ATP-binding) family transporter  34.21 
 
 
1226 aa  127  7e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0166966  normal  0.134886 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0085  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  34.11 
 
 
254 aa  126  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000203236  normal  0.523772 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08892  ABC multidrug transporter (Eurofung)  35.54 
 
 
1448 aa  126  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  32.43 
 
 
252 aa  126  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05770  xenobiotic-transporting ATPase, putative  32.87 
 
 
1536 aa  125  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16705  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  35.27 
 
 
323 aa  125  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  34.15 
 
 
247 aa  125  5e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0695  ABC transporter related protein  33.02 
 
 
328 aa  124  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0358  ABC transporter related  29.03 
 
 
303 aa  124  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  34.02 
 
 
355 aa  123  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  32.24 
 
 
307 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0060  ABC transporter related  37.85 
 
 
312 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57529  ATP dependent transporter multidrug resistance (SNQ2)  29.08 
 
 
1455 aa  122  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.088165  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  34.1 
 
 
342 aa  122  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00090  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  31.02 
 
 
1558 aa  122  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.120947  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  34.86 
 
 
345 aa  122  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10949  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VK5]  32.31 
 
 
1501 aa  121  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05194  ABC transporter (Eurofung)  35.93 
 
 
963 aa  121  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.177656  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4132  ABC transporter related  33.33 
 
 
328 aa  121  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.237334 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08928  ATP-binding cassette multidrug transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78576]  38.97 
 
 
1466 aa  120  7.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0515148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  32.19 
 
 
304 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  30.31 
 
 
299 aa  120  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  30.08 
 
 
318 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0603  ABC transporter-like protein  33.19 
 
 
317 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.858609 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  30.31 
 
 
299 aa  120  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  31.62 
 
 
319 aa  120  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  34.12 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.33 
 
 
240 aa  119  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  29.28 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0348  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  36.54 
 
 
605 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  29.28 
 
 
241 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0629  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  33.8 
 
 
244 aa  119  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  32.19 
 
 
512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  33.48 
 
 
304 aa  119  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  29.39 
 
 
248 aa  119  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  33.19 
 
 
286 aa  119  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  33.81 
 
 
327 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  32.23 
 
 
307 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0184  ATPase  31.62 
 
 
255 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77736  Opaque-specific ABC transporter CDR3  32.16 
 
 
1470 aa  118  3.9999999999999997e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  33.17 
 
 
309 aa  118  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85570  Multidrug resistance protein  31.84 
 
 
1505 aa  118  5e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.408248  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  36.02 
 
 
253 aa  118  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.69 
 
 
321 aa  118  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  35.07 
 
 
265 aa  118  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0257  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.12 
 
 
248 aa  118  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03247  ABC multidrug transporter (Eurofung)  36.32 
 
 
1457 aa  118  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  30.57 
 
 
306 aa  118  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  32.55 
 
 
247 aa  118  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  31.98 
 
 
292 aa  117  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2802  ABC transporter related  35.41 
 
 
312 aa  117  6.9999999999999995e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474892  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0861  ATPase  34.12 
 
 
363 aa  117  7.999999999999999e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1038  ATPase  34.12 
 
 
363 aa  117  7.999999999999999e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0249  ATPase  35.78 
 
 
261 aa  117  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  30.9 
 
 
344 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35308  ABC(ABCG) family transporter: pleiotropic drug  33.45 
 
 
1268 aa  117  8.999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0286  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.95 
 
 
307 aa  117  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  33.02 
 
 
242 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  32.33 
 
 
323 aa  117  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  26.48 
 
 
904 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.86 
 
 
506 aa  117  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>