25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1215 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_1215  PGAP1 family protein  100 
 
 
413 aa  822    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.765286  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1198  PGAP1-like protein  100 
 
 
413 aa  822    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0300  PGAP1 family protein  67.49 
 
 
407 aa  555  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76857  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2497  PGAP1 family protein  41.55 
 
 
418 aa  279  7e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2983  PGAP1 family protein  39.72 
 
 
437 aa  251  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1023  PGAP1 family protein  40.15 
 
 
399 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0358046  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0964  PGAP1-like  38.86 
 
 
414 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1026  PGAP1 family protein  39.51 
 
 
399 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3594  PGAP1 family protein  38.04 
 
 
449 aa  203  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3545  PGAP1-like  32.11 
 
 
423 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3190  PGAP1 family protein  35.21 
 
 
396 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4373  PGAP1-like  39.09 
 
 
374 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3479  PGAP1 family protein  44.05 
 
 
378 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0056  PGAP1 family protein  30.94 
 
 
387 aa  174  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3693  hypothetical protein  34.56 
 
 
304 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475055  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0514  PGAP1 family protein  32.15 
 
 
474 aa  152  8.999999999999999e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.513101 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0301  hypothetical protein  29.9 
 
 
488 aa  146  5e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0332  PGAP1-like  29.57 
 
 
487 aa  146  6e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2070  PGAP1 family protein  30.67 
 
 
495 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4965  hypothetical protein  47.06 
 
 
457 aa  49.7  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  29.59 
 
 
286 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2528  hypothetical protein  45.45 
 
 
459 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2532  PGAP1 family protein  30.06 
 
 
547 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.990857  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  25 
 
 
254 aa  43.1  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11350  PGAP1 family protein  23.04 
 
 
313 aa  43.1  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>