137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1186 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  96.88 
 
 
320 aa  596  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  70.14 
 
 
295 aa  409  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  68.33 
 
 
293 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  64.77 
 
 
301 aa  358  8e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  58 
 
 
320 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  58 
 
 
320 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  58 
 
 
320 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  51.54 
 
 
294 aa  269  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  47.8 
 
 
295 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  40 
 
 
289 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  36.36 
 
 
289 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  31.64 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  31.22 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  31.22 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  32.69 
 
 
278 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  31.22 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  32.77 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3121  hypothetical protein  34.19 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.829265  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  32.22 
 
 
307 aa  84  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  32.37 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  35.03 
 
 
286 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  35.03 
 
 
286 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  31.47 
 
 
280 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  31.75 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  31.75 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  31.78 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  31.28 
 
 
277 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  26.42 
 
 
283 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  32.1 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  38.84 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  31.33 
 
 
291 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  32.7 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0527  hypothetical protein  35.02 
 
 
307 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0459714  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  28.57 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  30.95 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0898  hypothetical protein  44.57 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  31.82 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  30.95 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  30.95 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  28.91 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5526  hypothetical protein  32.48 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1692  hypothetical protein  31.12 
 
 
303 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.360943  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  35.25 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4733  hypothetical protein  29.8 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.545142  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0865  hypothetical protein  30.91 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0633151  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  29.68 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  29.68 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  29.68 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  26.87 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  30.04 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2969  hypothetical protein  38.46 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3007  hypothetical protein  32.75 
 
 
424 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.153123  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4733  hypothetical protein  27.68 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0630614  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  29.83 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  26.22 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  31.76 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  28.72 
 
 
374 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0912  hypothetical protein  29.65 
 
 
289 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0938391  normal  0.0123481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4792  hypothetical protein  28.8 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  28.77 
 
 
306 aa  67  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  25.78 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4353  hypothetical protein  29.02 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  25.78 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4439  hypothetical protein  29.02 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  38.4 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29770  hypothetical protein  33.55 
 
 
275 aa  65.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  32.08 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1742  hypothetical protein  31.07 
 
 
303 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1099  hypothetical protein  31.33 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.994405  hitchhiker  0.000237406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  30 
 
 
262 aa  63.9  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  30.24 
 
 
297 aa  64.3  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4443  hypothetical protein  30.77 
 
 
291 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4530  hypothetical protein  30.77 
 
 
291 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.724398  normal  0.679375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  27.1 
 
 
289 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  27.1 
 
 
289 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2902  hypothetical protein  35.29 
 
 
319 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0740  hypothetical protein  36.22 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3163  hypothetical protein  32.92 
 
 
289 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  27.23 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1237  hypothetical protein  30.12 
 
 
307 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  31.33 
 
 
289 aa  60.1  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1656  hypothetical protein  30.04 
 
 
294 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  28.22 
 
 
289 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2535  hypothetical protein  28.03 
 
 
321 aa  60.1  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0539  hypothetical protein  30.61 
 
 
303 aa  59.7  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1730  hypothetical protein  28.17 
 
 
288 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432935  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0019  hypothetical protein  31.82 
 
 
317 aa  58.2  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0256854  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0680  hypothetical protein  32.08 
 
 
209 aa  58.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.366388 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1672  hypothetical protein  29.73 
 
 
329 aa  57.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.162701  hitchhiker  0.00245023 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2611  hypothetical protein  29.77 
 
 
319 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285658 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2924  hypothetical protein  32.8 
 
 
331 aa  56.6  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18420  hypothetical protein  31.3 
 
 
306 aa  56.2  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056172  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1915  hypothetical protein  35.34 
 
 
297 aa  55.8  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1395  hypothetical protein  30.49 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0744184  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1165  hypothetical protein  31.97 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000066316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3541  hypothetical protein  29.1 
 
 
347 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000177029  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0082  hypothetical protein  31.29 
 
 
337 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4722  hypothetical protein  36.36 
 
 
317 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>