96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1112 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1123  hypothetical protein  99.63 
 
 		 271 aa  531  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1112  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1095  hypothetical protein  99.63 
 
 		 271 aa  531  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1377  hypothetical protein  59.55 
 
 		 264 aa  304  8.000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5000  hypothetical protein  58.27 
 
 		 269 aa  287  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0837  hypothetical protein  50.92 
 
 		 269 aa  255  6e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310372  normal  0.564236 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10080  hypothetical protein  37.76 
 
 		 273 aa  106  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.244052  normal  0.0632242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1947  hypothetical protein  38.26 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.737946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1622  sigma 54 modulation protein / SSU ribosomal protein S30P  28.02 
 
 		 189 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21411  light repressed protein A-like protein  29.57 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.656968 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2774  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  28.14 
 
 		 191 aa  62  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.892766  normal  0.585222 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1422  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  28.25 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2024  hypothetical protein  45.35 
 
 		 123 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000012443  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0410  sigma 54 modulation protein/30S ribosomal protein S30EA  29.94 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2352  sigma 54 modulation protein / SSU ribosomal protein S30P  26.57 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1764  putative sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  35.25 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.625638  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2411  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  30.65 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00273718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04621  light repressed protein A-like protein  24.6 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.656438  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13290  ribosomal subunit interface protein  27.54 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04521  light repressed protein A-like protein  26.37 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3183  sigma 54 modulation protein / SSU ribosomal protein S30P  26.04 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237047  normal  0.086671 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1384  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  28.73 
 
 		 186 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000667858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3067  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  30.94 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.197605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2971  sigma-54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  26.86 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0546273  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03981  light repressed protein A-like protein  25.14 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0396  SSU ribosomal protein S30P / sigma 54 modulation protein  23.96 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.129079  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0658  putative sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  27.27 
 
 		 195 aa  57  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06910  ribosomal subunit interface protein  27.49 
 
 		 182 aa  57  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.576928  normal  0.223542 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0870  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  25.86 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3389  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  25 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1735  sigma 54 modulation protein / SSU ribosomal protein S30P  25.28 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04201  light repressed protein A-like protein  24.46 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.016107  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4311  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  27.84 
 
 		 185 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.370077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4466  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  25.28 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04511  light repressed protein A  24.46 
 
 		 194 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1284  SSU ribosomal protein S30P / sigma 54 modulation protein  28.88 
 
 		 181 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1886  ribosomal subunit interface protein  28.65 
 
 		 181 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.618476  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3882  SSU ribosomal protein S30P / sigma 54 modulation protein  25.43 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.907469 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2708  SSU ribosomal protein S30P / sigma 54 modulation protein  30.23 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2439  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  30.77 
 
 		 241 aa  52.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131636 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3221  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  26.72 
 
 		 205 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0724044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1937  ribosome-associated protein Y (PSrp-1)  24.58 
 
 		 182 aa  52.4  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2875  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  26.72 
 
 		 198 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2013  sigma 54 modulation protein / SSU ribosomal protein S30P  26.84 
 
 		 195 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2875  sigma 54 modulation protein / SSU ribosomal protein S30P  25.55 
 
 		 177 aa  50.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2068  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  50 
 
 		 180 aa  50.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2756  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  50 
 
 		 207 aa  48.9  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144256  normal  0.0289785 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0793  ribosomal subunit interface protein  24.56 
 
 		 190 aa  48.9  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.610491  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0776  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  24.56 
 
 		 190 aa  48.9  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.884905  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3032  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  24.86 
 
 		 214 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4187  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  21.71 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0749587 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4292  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  38.71 
 
 		 186 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0310009  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16460  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  24.75 
 
 		 184 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.802310000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2298  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  28.89 
 
 		 197 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.946442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3972  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  21.67 
 
 		 177 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000968423  unclonable  0.0000000000786009 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0227  sigma 54 modulation protein / SSU ribosomal protein S30P  27.93 
 
 		 190 aa  47.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1360  sigma 54 modulation protein / SSU ribosomal protein S30P  24.8 
 
 		 190 aa  47  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.221241  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0464  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  25.29 
 
 		 177 aa  47  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0419  ribosomal subunit interface protein  22.81 
 
 		 189 aa  47  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.731124  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0338  ribosomal subunit interface protein  25.23 
 
 		 184 aa  47  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1185  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  26.06 
 
 		 178 aa  45.8  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00855274  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2554  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  27.91 
 
 		 180 aa  45.8  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1823  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  31.65 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2165  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  27.78 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2081  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  47.5 
 
 		 174 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.311557  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0179  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  37.93 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.416833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1761  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  31.97 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1365  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  42.22 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.539551 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4748  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  22.22 
 
 		 175 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000816691  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3079  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  36.73 
 
 		 173 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000645797  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2105  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  34.69 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000156449  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0237  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  22.46 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000352191  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2035  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  37.88 
 
 		 193 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0975  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  22.6 
 
 		 182 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09380  ribosomal subunit interface protein  38.71 
 
 		 220 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0471  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  36.73 
 
 		 181 aa  43.9  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000151954  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0053  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  36.21 
 
 		 201 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149044  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0286  Ribosome-associated protein Y  44.19 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.928512  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0983  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  28 
 
 		 196 aa  43.5  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0654  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  36.21 
 
 		 202 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0543899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7590  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  32.14 
 
 		 237 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.651293  normal  0.272815 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14710  ribosomal subunit interface protein  41.86 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.393066  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1270  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  24.24 
 
 		 178 aa  43.5  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.640503  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1386  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  28.23 
 
 		 226 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.476709  normal  0.704497 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1370  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  28.23 
 
 		 226 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.924171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1352  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  28.23 
 
 		 226 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0211807  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0370  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  36.73 
 
 		 176 aa  42.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000278696  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3811  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  43.18 
 
 		 256 aa  42.7  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2222  sigma 54 modulation protein, SSU ribosomal protein S30P  25.32 
 
 		 178 aa  42.7  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000345731  decreased coverage  2.74921e-22 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30900  SSU ribosomal protein S30P/sigma 54 modulation protein  33.33 
 
 		 226 aa  42.7  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2507  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  39.19 
 
 		 216 aa  42.7  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0120  sigma 54 modulation protein / SSU ribosomal protein S30P  33.85 
 
 		 200 aa  42.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3197  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  38.1 
 
 		 182 aa  42.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0667  sigma 54 modulation protein / SSU ribosomal protein S30P  23.31 
 
 		 185 aa  42.4  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000156543  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3010  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  38.1 
 
 		 182 aa  42.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00246734  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6306  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  40 
 
 		 222 aa  42  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>