45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0967 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0949  PE-PPE-like protein  100 
 
 
529 aa  1067    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0970  hypothetical protein  74.72 
 
 
527 aa  742    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0967  hypothetical protein  100 
 
 
529 aa  1067    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0508627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1238  hypothetical protein  39.7 
 
 
518 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  39.44 
 
 
540 aa  247  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  29.02 
 
 
502 aa  102  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2869  hypothetical protein  28.54 
 
 
542 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2852  hypothetical protein  28.54 
 
 
542 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.493175  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2825  PE-PPE-like protein  28.54 
 
 
542 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0670236  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  30.46 
 
 
528 aa  101  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  24.87 
 
 
517 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  24.87 
 
 
517 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  27.95 
 
 
580 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  24.87 
 
 
517 aa  94  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  30.67 
 
 
468 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  28.35 
 
 
499 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  29.44 
 
 
433 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  29.44 
 
 
433 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  30 
 
 
413 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4726  hypothetical protein  23.74 
 
 
526 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4815  hypothetical protein  24.46 
 
 
517 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036701  normal  0.942051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  28.13 
 
 
458 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  26.2 
 
 
427 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  25.42 
 
 
655 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  32.91 
 
 
494 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  25.17 
 
 
533 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  26.83 
 
 
768 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0017  hypothetical protein  27.51 
 
 
630 aa  58.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  29.33 
 
 
341 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  29.33 
 
 
341 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  25.83 
 
 
404 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3371  hypothetical protein  31.33 
 
 
431 aa  57  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21394  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1918  hypothetical protein  25.25 
 
 
533 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.777477  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3102  hypothetical protein  26.07 
 
 
410 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057545  normal  0.238846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  27.56 
 
 
421 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5244  hypothetical protein  30.58 
 
 
433 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  30.67 
 
 
423 aa  52  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  26.89 
 
 
588 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1838  hypothetical protein  29.81 
 
 
435 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.896009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  29.44 
 
 
391 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3103  hypothetical protein  26.67 
 
 
413 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0463748  normal  0.241935 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4691  hypothetical protein  35.37 
 
 
451 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  25.45 
 
 
401 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4397  hypothetical protein  34.15 
 
 
451 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4311  PE-PPE-like protein  34.15 
 
 
451 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>