64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0880 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  91.83 
 
 
1126 aa  2136    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  99.2 
 
 
1118 aa  2242    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  94.1 
 
 
1120 aa  2165    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  100 
 
 
1120 aa  2285    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  55.97 
 
 
1121 aa  1206    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  100 
 
 
1120 aa  2285    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  33.25 
 
 
1120 aa  433  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  29.02 
 
 
1126 aa  328  4.0000000000000003e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  27.71 
 
 
1124 aa  302  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  26.99 
 
 
1143 aa  287  8e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  27.7 
 
 
1137 aa  287  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  27.75 
 
 
1128 aa  281  4e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  27.5 
 
 
1118 aa  260  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  26.31 
 
 
1125 aa  249  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  23.79 
 
 
1144 aa  248  4e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  25.3 
 
 
1136 aa  247  9.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  25.39 
 
 
1140 aa  245  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  25.74 
 
 
1123 aa  243  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3738  putative ATP-binding protein  25.34 
 
 
1153 aa  240  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3940  putative ATP-binding protein  25.51 
 
 
1154 aa  229  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  24.98 
 
 
1130 aa  228  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  24.82 
 
 
1151 aa  228  5.0000000000000005e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  24.8 
 
 
1121 aa  226  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  23.59 
 
 
1143 aa  226  2e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  24.23 
 
 
1122 aa  226  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  24.67 
 
 
1125 aa  225  4e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  25.42 
 
 
1124 aa  222  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  23.18 
 
 
1133 aa  218  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  25.77 
 
 
1120 aa  216  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  23.96 
 
 
1121 aa  214  5.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  24.43 
 
 
1121 aa  213  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  23.3 
 
 
1121 aa  211  5e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  25.8 
 
 
1146 aa  205  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  25.07 
 
 
1114 aa  198  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  24.87 
 
 
1125 aa  194  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  26.68 
 
 
1166 aa  174  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  27.03 
 
 
1121 aa  158  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  23.57 
 
 
1045 aa  157  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  27.33 
 
 
1133 aa  156  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  23.51 
 
 
979 aa  150  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3697  hypothetical protein  23.89 
 
 
694 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000334148 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3696  hypothetical protein  25.85 
 
 
406 aa  88.6  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000237881 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0741  hypothetical protein  29.46 
 
 
352 aa  87.8  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0424  hypothetical protein  24.44 
 
 
1181 aa  83.2  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.924929  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  25.16 
 
 
462 aa  82.4  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2117  conserved hypothetical proteinn  31.17 
 
 
1159 aa  57.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  26.99 
 
 
1207 aa  57.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2434  hypothetical protein  32.26 
 
 
1159 aa  57.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.0878063 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2156  hypothetical protein  32.26 
 
 
1159 aa  57  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0795  hypothetical protein  30.83 
 
 
1145 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.517535 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2223  hypothetical protein  30.28 
 
 
1138 aa  53.5  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.651164 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  23.47 
 
 
1109 aa  52  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  19.54 
 
 
1113 aa  52  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  27.24 
 
 
1093 aa  51.6  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  41.86 
 
 
1226 aa  48.5  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  41.86 
 
 
1226 aa  48.5  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  44.19 
 
 
1190 aa  48.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  39.53 
 
 
1208 aa  47.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  45.45 
 
 
1082 aa  47  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  39.53 
 
 
1217 aa  47  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  34.48 
 
 
1146 aa  46.2  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4582  Sigma 54 interacting domain protein  30.23 
 
 
1228 aa  46.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  26.36 
 
 
1146 aa  45.4  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  30.77 
 
 
1219 aa  45.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>