155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0846 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  100 
 
 		 609 aa  1252    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  100 
 
 		 609 aa  1252    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  56.71 
 
 		 781 aa  355  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  57.73 
 
 		 810 aa  354  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  53.75 
 
 		 734 aa  336  7e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  61.54 
 
 		 655 aa  287  5e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  41.84 
 
 		 459 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.18 
 
 		 465 aa  252  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  41.84 
 
 		 459 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  43.97 
 
 		 805 aa  249  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.27 
 
 		 421 aa  227  4e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.76 
 
 		 732 aa  224  3e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  39.93 
 
 		 822 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.34 
 
 		 502 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.41 
 
 		 683 aa  173  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  40.15 
 
 		 539 aa  171  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  38.24 
 
 		 629 aa  171  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.07 
 
 		 754 aa  168  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  40.07 
 
 		 741 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  36.42 
 
 		 700 aa  164  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.84 
 
 		 729 aa  163  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  38.04 
 
 		 678 aa  157  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  38.17 
 
 		 853 aa  156  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  38.24 
 
 		 743 aa  153  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.27 
 
 		 743 aa  153  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.37 
 
 		 765 aa  149  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  36.07 
 
 		 698 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.25 
 
 		 568 aa  147  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  36.64 
 
 		 587 aa  146  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  35.25 
 
 		 705 aa  146  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.8 
 
 		 626 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  37.69 
 
 		 899 aa  143  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3670  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.16 
 
 		 685 aa  141  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1298  ATPase  34.36 
 
 		 999 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00022527  normal  0.161034 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.26 
 
 		 590 aa  138  3.0000000000000003e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  31.21 
 
 		 638 aa  133  9e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.21 
 
 		 585 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  36.24 
 
 		 691 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.77 
 
 		 530 aa  132  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3331  ATPase  36.24 
 
 		 685 aa  132  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2910  ATPase  44.89 
 
 		 900 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  30.54 
 
 		 666 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  32.1 
 
 		 498 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  39.43 
 
 		 517 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0004  hypothetical protein  33.81 
 
 		 845 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00169415  unclonable  0.0000000310884 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1239  hypothetical protein  38.89 
 
 		 687 aa  115  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793158  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1653  hypothetical protein  40.34 
 
 		 517 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  38.17 
 
 		 662 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  33.2 
 
 		 498 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  38.17 
 
 		 603 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7438  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  36.46 
 
 		 696 aa  112  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  31.96 
 
 		 303 aa  112  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4727  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  40.45 
 
 		 722 aa  110  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162949  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4620  ATPase  35.98 
 
 		 862 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00433872  decreased coverage  0.0000000142009 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2031  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  33.02 
 
 		 481 aa  110  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0504678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.01 
 
 		 723 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.21 
 
 		 398 aa  110  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1980  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  43.18 
 
 		 605 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1590  AAA_5 ATPase  38.2 
 
 		 834 aa  107  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1973  ATPase  34.89 
 
 		 450 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0978731  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3469  hypothetical protein  31.76 
 
 		 851 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0603195  normal  0.212909 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  33.33 
 
 		 412 aa  103  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  37.16 
 
 		 571 aa  101  5e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  30.08 
 
 		 653 aa  97.1  8e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  39.6 
 
 		 598 aa  95.9  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4335  R1.LlaJI  30.52 
 
 		 352 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0970612  hitchhiker  0.000000213908 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1562  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.46 
 
 		 603 aa  92.4  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3008  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.39 
 
 		 449 aa  87.8  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  43.4 
 
 		 305 aa  85.9  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1909  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.28 
 
 		 795 aa  86.3  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1009  type II restriction-modification system restriction subunit  30.92 
 
 		 513 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.61014e-61 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  38.58 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0817  ATPase  29.95 
 
 		 513 aa  84  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11951  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  29.96 
 
 		 803 aa  82.4  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  34.45 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.15 
 
 		 530 aa  76.6  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.67 
 
 		 510 aa  75.5  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293694 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.15 
 
 		 651 aa  75.5  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0015  putative 5-methylcytosine-specific restriction enzyme B  26.82 
 
 		 597 aa  74.7  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0700  ATPase  30.15 
 
 		 714 aa  73.6  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1597  ATPase  30.15 
 
 		 714 aa  73.6  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0251124  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.98 
 
 		 748 aa  72.8  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  35.09 
 
 		 304 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.13 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  34.91 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  35.78 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1001  ATPase  29.78 
 
 		 474 aa  64.3  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00172806  hitchhiker  0.00521543 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3197  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.03 
 
 		 542 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.046131  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.57 
 
 		 606 aa  63.5  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1053  ATPase  29.76 
 
 		 523 aa  63.5  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.603764 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1023  ATPase  28.14 
 
 		 599 aa  62.8  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4197  ATPase  28.21 
 
 		 578 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.558563  normal  0.0514875 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1858  ATPase  32.58 
 
 		 524 aa  62  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.31 
 
 		 668 aa  62  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130676 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1826  ATPase  26.34 
 
 		 583 aa  61.6  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0028  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  30.05 
 
 		 751 aa  61.2  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0069  ATPase  29.21 
 
 		 475 aa  60.8  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.977375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  29.13 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  27.47 
 
 		 847 aa  60.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  27.47 
 
 		 843 aa  60.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>