139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0828 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  40.45 
 
 		 1363 aa  880    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  49.19 
 
 		 1366 aa  1174    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  41.1 
 
 		 1440 aa  863    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  100 
 
 		 1339 aa  2690    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  41.72 
 
 		 1346 aa  920    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  52.27 
 
 		 1347 aa  1276    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  54.19 
 
 		 1365 aa  1307    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  100 
 
 		 1339 aa  2690    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  35.33 
 
 		 1452 aa  665    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  35.28 
 
 		 1461 aa  664    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  39.06 
 
 		 1347 aa  796    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  37.03 
 
 		 1409 aa  773    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  34.87 
 
 		 1441 aa  630  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  31.04 
 
 		 1321 aa  498  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  30.8 
 
 		 1342 aa  489  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  30.79 
 
 		 1353 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  35.41 
 
 		 846 aa  381  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  32.51 
 
 		 1290 aa  378  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  42.68 
 
 		 536 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  31.98 
 
 		 1282 aa  367  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  38.98 
 
 		 1243 aa  295  4e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  26.86 
 
 		 1581 aa  147  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  27.22 
 
 		 1151 aa  146  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  30 
 
 		 918 aa  146  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  29 
 
 		 925 aa  140  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2201  hypothetical protein  26.43 
 
 		 512 aa  138  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00286901  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  33.23 
 
 		 1338 aa  135  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  28.29 
 
 		 978 aa  135  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  31.2 
 
 		 1712 aa  130  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  27.94 
 
 		 1432 aa  123  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  31.4 
 
 		 1358 aa  121  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1612 aa  120  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  30.59 
 
 		 1306 aa  119  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  31.11 
 
 		 1331 aa  119  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  45.16 
 
 		 1338 aa  119  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  31.43 
 
 		 1422 aa  118  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  31.22 
 
 		 1319 aa  117  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  30.48 
 
 		 1355 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1018 aa  115  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  42.41 
 
 		 1343 aa  115  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1173 aa  114  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  38.96 
 
 		 1354 aa  112  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1170 aa  112  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  29.86 
 
 		 1318 aa  111  8.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  29.78 
 
 		 1219 aa  111  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1426 aa  110  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  40.62 
 
 		 1339 aa  109  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  29.97 
 
 		 1336 aa  109  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1333 aa  105  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  27.86 
 
 		 1278 aa  104  1e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  29.46 
 
 		 1322 aa  104  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1154 aa  100  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  37.27 
 
 		 1373 aa  100  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  25.82 
 
 		 1277 aa  100  2e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1022 aa  98.2  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1375 aa  97.8  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  29.06 
 
 		 1321 aa  95.1  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  37.27 
 
 		 1459 aa  95.1  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  30.04 
 
 		 1055 aa  93.2  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  25 
 
 		 1098 aa  91.3  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  25.62 
 
 		 973 aa  88.6  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1644 aa  87.8  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  26.25 
 
 		 1640 aa  87  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1184 aa  86.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1642 aa  86.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1640 aa  86.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1250 aa  85.5  0.000000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  23.59 
 
 		 1250 aa  85.5  0.000000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1188 aa  84  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  34.62 
 
 		 926 aa  84  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  23.37 
 
 		 1751 aa  83.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  23.94 
 
 		 869 aa  82.4  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  36.36 
 
 		 1322 aa  80.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  23.72 
 
 		 1557 aa  79.3  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1332 aa  79  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  32.02 
 
 		 1709 aa  79.3  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1572 aa  78.2  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  24.57 
 
 		 1186 aa  77.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1104 aa  77.8  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  31.07 
 
 		 1349 aa  77.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1184 aa  76.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  22.61 
 
 		 1209 aa  75.9  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  22.75 
 
 		 838 aa  72  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1575 aa  72  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  26.67 
 
 		 882 aa  72  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1579 aa  70.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  25.06 
 
 		 926 aa  70.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  21.59 
 
 		 1252 aa  69.7  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  21.72 
 
 		 1256 aa  69.7  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1426  RNA-binding region RNP-1  25.29 
 
 		 430 aa  69.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  20.77 
 
 		 1257 aa  69.3  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  37.84 
 
 		 1177 aa  68.2  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  21.67 
 
 		 1186 aa  68.2  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  28.95 
 
 		 1041 aa  67  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  20.77 
 
 		 1244 aa  66.6  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  29.61 
 
 		 974 aa  63.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  31.44 
 
 		 1573 aa  63.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  22.52 
 
 		 1020 aa  63.2  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1154 aa  62.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  35.29 
 
 		 995 aa  62.4  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>