More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0826 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  62.5 
 
 
696 aa  884    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2733  UvrD/REP helicase  58.18 
 
 
705 aa  827    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2728  UvrD/REP helicase  52.65 
 
 
699 aa  720    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  100 
 
 
703 aa  1429    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  100 
 
 
703 aa  1429    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  46.84 
 
 
708 aa  592  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  38.76 
 
 
711 aa  459  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8440  UvrD/REP helicase  39.83 
 
 
685 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1352  UvrD/REP helicase  37.82 
 
 
712 aa  418  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.541991 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5811  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  37.32 
 
 
704 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.859027 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4831  ATP-dependent DNA helicase UvrD  37.46 
 
 
704 aa  413  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366653  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3882  UvrD/REP helicase  37.32 
 
 
704 aa  413  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.229228  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4897  UvrD/REP helicase  37.09 
 
 
705 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1419  UvrD/REP helicase  35.98 
 
 
706 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3032  UvrD/REP family ATP-dependent DNA helicase  34.98 
 
 
687 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.722257  normal  0.242361 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35190  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.13 
 
 
737 aa  367  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0467  UvrD/REP helicase  41.79 
 
 
603 aa  365  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82885  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0110  putative DNA helicase  38.53 
 
 
659 aa  350  5e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2329  superfamily protein I DNA/RNA helicase  39.43 
 
 
679 aa  321  3.9999999999999996e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0355  UvrD/REP helicase  32.3 
 
 
714 aa  318  3e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1320  superfamily I DNA/RNA helicase  31.3 
 
 
683 aa  313  6.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.875169  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  32.83 
 
 
737 aa  311  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3740  UvrD/REP helicase  32.03 
 
 
752 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5423  UvrD/REP helicase  31.29 
 
 
821 aa  304  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106532  normal  0.207547 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  33.24 
 
 
696 aa  290  8e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  32.75 
 
 
690 aa  290  8e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2325  hypothetical protein  32.12 
 
 
759 aa  287  5e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0788129  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  31.71 
 
 
716 aa  286  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  32.76 
 
 
673 aa  270  7e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3085  UvrD/Rep helicase  33.86 
 
 
717 aa  267  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.173371  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  32.19 
 
 
662 aa  249  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  30.54 
 
 
697 aa  178  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  30.58 
 
 
809 aa  178  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  31.49 
 
 
734 aa  176  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  28.96 
 
 
710 aa  170  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  30.62 
 
 
712 aa  159  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  29.98 
 
 
700 aa  159  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  28.24 
 
 
695 aa  146  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  26.59 
 
 
695 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  28.85 
 
 
663 aa  128  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  25.1 
 
 
815 aa  126  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  23.18 
 
 
819 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4061  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  25.84 
 
 
1107 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  27.98 
 
 
671 aa  109  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  27.04 
 
 
508 aa  97.1  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  28.69 
 
 
593 aa  94.4  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  29.17 
 
 
619 aa  87.8  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  22.66 
 
 
564 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  31.13 
 
 
625 aa  80.5  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  28.61 
 
 
710 aa  78.2  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  29.92 
 
 
615 aa  77.8  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0928  UvrD/REP helicase  27.86 
 
 
876 aa  75.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.39 
 
 
694 aa  74.7  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  25.19 
 
 
613 aa  74.7  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  26.98 
 
 
612 aa  73.9  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  30.13 
 
 
1089 aa  73.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.98 
 
 
699 aa  73.2  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  27.06 
 
 
619 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  25.37 
 
 
646 aa  73.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  27.84 
 
 
1032 aa  72.4  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  26.63 
 
 
701 aa  73.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  22.37 
 
 
714 aa  72.4  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  25.75 
 
 
736 aa  72.4  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  27.18 
 
 
1127 aa  71.6  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  26.56 
 
 
601 aa  71.2  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.81 
 
 
783 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1549  hypothetical protein  31.43 
 
 
465 aa  70.5  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.400172  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  25.17 
 
 
1244 aa  70.5  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  24.94 
 
 
726 aa  70.5  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  25.84 
 
 
1033 aa  70.1  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  25.32 
 
 
717 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  26.38 
 
 
682 aa  69.7  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  25.56 
 
 
783 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  26.79 
 
 
741 aa  68.9  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  26.28 
 
 
702 aa  68.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  27.65 
 
 
607 aa  68.6  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  27.85 
 
 
797 aa  67.8  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1455  UvrD/REP helicase  23.08 
 
 
715 aa  67.8  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  28 
 
 
753 aa  67.8  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  24.52 
 
 
712 aa  67.4  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2914  hypothetical protein  24.35 
 
 
658 aa  67.4  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  23.64 
 
 
616 aa  67.4  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  24.87 
 
 
689 aa  67.4  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  27.56 
 
 
797 aa  67.4  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.45 
 
 
725 aa  67  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.94 
 
 
794 aa  67  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  26.89 
 
 
674 aa  66.6  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  26.09 
 
 
697 aa  66.2  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  26.55 
 
 
726 aa  65.9  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  26.23 
 
 
727 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.37 
 
 
932 aa  65.1  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  25.81 
 
 
795 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.13 
 
 
762 aa  65.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  24.94 
 
 
668 aa  65.1  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  25.32 
 
 
659 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1045  UvrD/REP helicase  24.65 
 
 
587 aa  64.7  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52657  normal  0.201232 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.68 
 
 
795 aa  64.7  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  26.51 
 
 
728 aa  64.3  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  26.51 
 
 
728 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.97 
 
 
738 aa  63.5  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>