180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0796 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0781  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0796  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0777  MarR family transcriptional regulator  98.97 
 
 		 194 aa  390  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  61.18 
 
 		 172 aa  184  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  61.18 
 
 		 172 aa  184  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  34.53 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 		 159 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12510  transcriptional regulator  35.1 
 
 		 161 aa  74.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  30.61 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 168 aa  72  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 		 169 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  34.44 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4301  transcriptional regulator, MarR family  31.72 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  34.04 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  30.13 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  29.53 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  30.2 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  31.3 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  31.01 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  29.03 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 159 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 		 166 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 151 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 151 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 151 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 		 170 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  28.06 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  28.86 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  30.77 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 168 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  31.67 
 
 		 163 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  30.26 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0281  regulatory protein MarR  26.53 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  36.84 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2515  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 174 aa  53.1  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  28.77 
 
 		 149 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 153 aa  52.4  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  25.53 
 
 		 168 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 163 aa  51.6  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00960  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  51.2  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4466  transcriptional regulator, MarR family  37.17 
 
 		 179 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120137  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 		 164 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  26.24 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  35.23 
 
 		 150 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0927  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1179  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 141 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1196  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 141 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2941  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.760695  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  32.06 
 
 		 163 aa  48.9  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  40.79 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1206  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 141 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.0194653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  35.29 
 
 		 140 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 166 aa  48.5  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  37.11 
 
 		 160 aa  48.5  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  25 
 
 		 166 aa  48.5  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7355  transcriptional regulator, MarR family  24.44 
 
 		 148 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.238982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  38.16 
 
 		 177 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>