More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0524 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 492 aa  963    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  99.8 
 
 		 492 aa  960    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 492 aa  963    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  29.93 
 
 		 461 aa  168  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  29.04 
 
 		 521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  28.09 
 
 		 491 aa  143  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  29.77 
 
 		 495 aa  139  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  28.43 
 
 		 477 aa  138  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  29.15 
 
 		 486 aa  136  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 450 aa  130  6e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  27.4 
 
 		 497 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 		 501 aa  129  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  27.52 
 
 		 490 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 459 aa  124  5e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  28.67 
 
 		 487 aa  118  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  24.14 
 
 		 504 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 526 aa  117  6e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  25.7 
 
 		 510 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 		 516 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  26.96 
 
 		 506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  30.79 
 
 		 495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  26.28 
 
 		 510 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  26.28 
 
 		 510 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  29.54 
 
 		 502 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  26.33 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  29.54 
 
 		 502 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  29.54 
 
 		 511 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  26.93 
 
 		 450 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  28.23 
 
 		 484 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  25.52 
 
 		 513 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  26.68 
 
 		 450 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 450 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  27.14 
 
 		 489 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  28.61 
 
 		 479 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  28.61 
 
 		 479 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 		 443 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 		 443 aa  103  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  26.06 
 
 		 443 aa  103  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 		 443 aa  103  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 484 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  26.3 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  23.99 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  30.53 
 
 		 507 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  27.3 
 
 		 486 aa  100  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1819  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 		 474 aa  99.8  9e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.757233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 		 509 aa  99.4  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  25.78 
 
 		 443 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  26.51 
 
 		 475 aa  99.4  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  29.28 
 
 		 485 aa  99  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 443 aa  98.6  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  24.23 
 
 		 456 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  25.78 
 
 		 443 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  25.21 
 
 		 443 aa  97.8  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  26.06 
 
 		 494 aa  97.8  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  27.07 
 
 		 485 aa  97.1  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  29.75 
 
 		 516 aa  97.1  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  28.65 
 
 		 485 aa  96.3  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 482 aa  96.3  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  24.02 
 
 		 483 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  25.21 
 
 		 443 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  25.29 
 
 		 462 aa  94.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1095  amino acid permease-associated region  25.15 
 
 		 455 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.212668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  24.23 
 
 		 461 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  23.66 
 
 		 456 aa  94  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  23.94 
 
 		 461 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  23.94 
 
 		 461 aa  93.2  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  27.3 
 
 		 497 aa  93.2  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  23.94 
 
 		 461 aa  93.2  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  23.94 
 
 		 461 aa  93.2  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1095  amino acid permease-associated region  24.85 
 
 		 455 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  23.66 
 
 		 461 aa  92  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0710  amino acid permease-associated region  26.44 
 
 		 513 aa  92.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4320  amino acid transporter  24.85 
 
 		 455 aa  92.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.619853  normal  0.387948 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  26.76 
 
 		 491 aa  92  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 		 491 aa  91.7  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  27.69 
 
 		 493 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2573  amino acid permease-associated region  24.65 
 
 		 457 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  23.3 
 
 		 461 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0732  amino acid permease-associated region  24.85 
 
 		 455 aa  91.3  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.486551  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  25.78 
 
 		 443 aa  90.9  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1212  amino acid permease-associated region  24.85 
 
 		 455 aa  91.3  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2756  amino acid permease-associated region  26.85 
 
 		 497 aa  90.9  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00077559 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  26.5 
 
 		 496 aa  90.5  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  25.48 
 
 		 510 aa  90.5  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  25.06 
 
 		 464 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  23.38 
 
 		 461 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  23.79 
 
 		 486 aa  89.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2091  amino acid permease-associated region  24.54 
 
 		 455 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4371  amino acid permease-associated region  23.64 
 
 		 446 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670873  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  25.33 
 
 		 464 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3995  amino acid permease-associated region  23.64 
 
 		 446 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140691  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  23.79 
 
 		 486 aa  89.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1984  amino acid permease-associated region  23.86 
 
 		 468 aa  88.2  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  28.08 
 
 		 485 aa  87.8  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 482 aa  87.4  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4368  amino acid permease-associated region  24.64 
 
 		 457 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 482 aa  87.4  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4749  amino acid permease-associated region  24.64 
 
 		 457 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1385  amino acid transporter  24.62 
 
 		 454 aa  87.4  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>