More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0453 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10344  transcriptional regulator  59.38 
 
 		 832 aa  801    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0443  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 845 aa  1611    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0453  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 845 aa  1611    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00902802  normal  0.164527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0620  response regulator receiver protein  70.25 
 
 		 843 aa  1010    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0430  LuxR family transcriptional regulator  98.58 
 
 		 845 aa  1581    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.32699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0277  response regulator receiver protein  67.22 
 
 		 833 aa  909    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  34.72 
 
 		 836 aa  287  5e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0559  transcriptional regulator, LuxR family  33.76 
 
 		 788 aa  273  7e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3086  transcriptional regulator, LuxR family  37.24 
 
 		 695 aa  264  4.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1635  LuxR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 818 aa  171  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1650  regulatory protein, LuxR  37.05 
 
 		 794 aa  168  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315022  normal  0.343942 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 814 aa  61.2  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4437  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 		 218 aa  60.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.784745  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 215 aa  59.7  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  37.5 
 
 		 855 aa  58.9  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  47.76 
 
 		 959 aa  58.9  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  40.91 
 
 		 900 aa  57.8  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1403  hypothetical protein  40.68 
 
 		 252 aa  56.6  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4226  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 210 aa  57  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.1 
 
 		 217 aa  56.2  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  47.22 
 
 		 916 aa  56.6  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 755 aa  56.2  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  54.9 
 
 		 937 aa  56.2  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  36.78 
 
 		 1052 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 228 aa  55.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1255  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 		 219 aa  55.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.490147  normal  0.40644 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2601  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.83 
 
 		 234 aa  55.8  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1212  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0642  putative response regulator  37.93 
 
 		 217 aa  55.5  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2543  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 217 aa  55.5  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.473476  normal  0.787864 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  40.59 
 
 		 977 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  50 
 
 		 228 aa  55.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 919 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4906  response regulator receiver  41.05 
 
 		 205 aa  55.1  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275081  normal  0.875639 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  44.78 
 
 		 919 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  44.78 
 
 		 919 aa  55.5  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 929 aa  54.7  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0710  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 226 aa  54.3  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.614335  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3437  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 248 aa  54.3  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39912  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3033  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 232 aa  54.3  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666463  hitchhiker  0.000783277 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 211 aa  54.3  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  37.86 
 
 		 910 aa  54.3  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0656  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 218 aa  53.9  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.214241 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28320  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.08 
 
 		 220 aa  53.5  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 203 aa  53.9  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1769  putative response regulator  46.15 
 
 		 231 aa  53.9  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.76 
 
 		 907 aa  53.9  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 876 aa  53.9  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  49.02 
 
 		 963 aa  53.5  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 550 aa  53.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17340  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  48.08 
 
 		 232 aa  53.1  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  41.79 
 
 		 212 aa  53.5  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3606  regulatory protein, LuxR  46.15 
 
 		 229 aa  53.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.527821  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  47.17 
 
 		 919 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  38.54 
 
 		 864 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0277  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 228 aa  53.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.0298075 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  43.94 
 
 		 212 aa  53.5  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 222 aa  53.5  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4160  transcriptional regulator, LuxR family  46.88 
 
 		 872 aa  53.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  30.7 
 
 		 894 aa  52.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 215 aa  52  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.721789  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 881 aa  52.4  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 881 aa  52.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3894  response regulator receiver protein  42.65 
 
 		 208 aa  52  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.52621  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 876 aa  52.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  40.3 
 
 		 233 aa  52  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.02 
 
 		 215 aa  52  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  36.92 
 
 		 893 aa  51.6  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 241 aa  51.6  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  38.64 
 
 		 933 aa  51.6  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 		 973 aa  51.6  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  51.79 
 
 		 799 aa  51.6  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.06 
 
 		 862 aa  51.2  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5726  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 228 aa  51.6  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 214 aa  51.2  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 226 aa  51.2  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 1030 aa  51.2  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33440  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.45 
 
 		 938 aa  51.2  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0316  LuxR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 341 aa  50.8  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  45.28 
 
 		 218 aa  51.2  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3154  transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 1089 aa  50.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.639432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4851  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  33.78 
 
 		 237 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0743346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.28 
 
 		 218 aa  50.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 224 aa  50.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4366  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.8 
 
 		 225 aa  50.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2998  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 228 aa  50.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  45.16 
 
 		 574 aa  50.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0846  two component LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 209 aa  50.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 215 aa  50.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 936 aa  50.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4026  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 200 aa  50.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.105506  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  39.34 
 
 		 943 aa  50.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4385  germination protein GerE  42.11 
 
 		 74 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4238  germination protein  42.11 
 
 		 74 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5633  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.4 
 
 		 203 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.603295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4724  germination protein GerE  42.11 
 
 		 74 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.105908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3205  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 74 aa  49.7  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.826126  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 947 aa  50.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 303 aa  49.7  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  46.03 
 
 		 567 aa  49.7  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 889 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>