More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0437 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 544 aa  1075    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 544 aa  1075    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  99.63 
 
 		 544 aa  1071    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  49.91 
 
 		 541 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 554 aa  435  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2591  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 552 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000770971 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1927  transcriptional regulator, LuxR family  47.57 
 
 		 535 aa  391  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2885  LuxR family transcriptional regulator  45.4 
 
 		 545 aa  362  7.0000000000000005e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.488052  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2609  transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 562 aa  300  6e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000030036  hitchhiker  0.00837555 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1794  transcriptional regulator, LuxR family  36.38 
 
 		 537 aa  216  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000182459 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3766  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 539 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484632  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3379  LuxR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 542 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3441  response regulator receiver protein  34.16 
 
 		 542 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0174834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3390  response regulator receiver protein  34.16 
 
 		 542 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2045  LuxR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 547 aa  199  9e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3284  transcriptional regulator, CadC  33.81 
 
 		 584 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.58115 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4920  LuxR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 545 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  30.06 
 
 		 567 aa  91.3  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  28.7 
 
 		 574 aa  89.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  65.57 
 
 		 209 aa  82.8  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  46.77 
 
 		 916 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.45 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  36.16 
 
 		 929 aa  80.1  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  29.97 
 
 		 977 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  41.98 
 
 		 1006 aa  78.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4433  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  40.94 
 
 		 982 aa  76.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  37.9 
 
 		 516 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  34.59 
 
 		 919 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.02 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  31.67 
 
 		 954 aa  73.9  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.74 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  57.14 
 
 		 917 aa  72.8  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 207 aa  72.8  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  40.62 
 
 		 207 aa  72.8  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 213 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.32 
 
 		 213 aa  72  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  31.06 
 
 		 919 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  30.91 
 
 		 927 aa  71.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.98 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  34.97 
 
 		 921 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3475  response regulator receiver  52.78 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 895 aa  70.5  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 921 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  55 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  34.97 
 
 		 921 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  47.19 
 
 		 992 aa  69.7  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  39.23 
 
 		 970 aa  70.1  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  32.79 
 
 		 921 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 1000 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  55 
 
 		 210 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  55 
 
 		 210 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  55 
 
 		 210 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  55 
 
 		 210 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  55 
 
 		 210 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  32.67 
 
 		 893 aa  68.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  55 
 
 		 210 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  45.28 
 
 		 206 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  55 
 
 		 210 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  55 
 
 		 210 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  55 
 
 		 210 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  41.41 
 
 		 239 aa  68.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  44.23 
 
 		 234 aa  68.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  54.84 
 
 		 213 aa  68.6  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  38.78 
 
 		 959 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 222 aa  68.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.53 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 973 aa  68.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  32.22 
 
 		 919 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  41.44 
 
 		 993 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 1084 aa  68.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0651  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.38 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  50.77 
 
 		 1022 aa  68.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 919 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.74 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  32.22 
 
 		 919 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5522  two component LuxR family transcriptional regulator  57.38 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  53.52 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  53.85 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  37.16 
 
 		 910 aa  67.8  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1611  two component LuxR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal  0.234442 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  57.38 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  55.74 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  32.19 
 
 		 928 aa  67.8  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3826  transcriptional regulator, LuxR family  58.06 
 
 		 519 aa  67.8  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  35.37 
 
 		 923 aa  67.8  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 219 aa  67  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1592  two component LuxR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 162 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1619  two component LuxR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 163 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113726  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 163 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  56.45 
 
 		 959 aa  67  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>