More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0412 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
291 aa  580  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
291 aa  580  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
291 aa  580  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  66.55 
 
 
290 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  66.06 
 
 
287 aa  374  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  65.12 
 
 
291 aa  372  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  62.59 
 
 
295 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  47.99 
 
 
301 aa  251  8.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  48.57 
 
 
333 aa  241  7.999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  47.84 
 
 
361 aa  238  6.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  46.62 
 
 
341 aa  236  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  47.27 
 
 
298 aa  233  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  45.99 
 
 
340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  45.99 
 
 
340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  46.59 
 
 
350 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  45.99 
 
 
340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  45.64 
 
 
340 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  46.59 
 
 
340 aa  228  9e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  46.76 
 
 
309 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  43.32 
 
 
314 aa  226  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  45.94 
 
 
350 aa  224  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  46.07 
 
 
322 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
296 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  34.36 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  32.94 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  29.05 
 
 
300 aa  125  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  31.87 
 
 
313 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 
312 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 
300 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  28.72 
 
 
300 aa  123  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  31.14 
 
 
313 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  26.53 
 
 
300 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
339 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  28.33 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 
275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  32.38 
 
 
284 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  26.46 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  27.11 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 
287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  27.3 
 
 
300 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  26.76 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  26.76 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 
329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
339 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  31.64 
 
 
340 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
287 aa  108  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.99 
 
 
372 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  23.99 
 
 
281 aa  108  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 
340 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
309 aa  106  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 
304 aa  106  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 
346 aa  105  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
264 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 
280 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 
284 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 
271 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
270 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 
271 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  35.13 
 
 
290 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 
315 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
276 aa  103  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.02 
 
 
367 aa  102  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 
281 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 
279 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  29.71 
 
 
270 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  31.27 
 
 
310 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.9 
 
 
369 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
316 aa  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
270 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
270 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  28.82 
 
 
299 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.13 
 
 
370 aa  99.4  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
267 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2256  alpha/beta hydrolase fold protein  32.97 
 
 
297 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2307  alpha/beta hydrolase fold protein  32.97 
 
 
297 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.960741 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0519  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 
297 aa  97.4  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
286 aa  96.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.95 
 
 
371 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.95 
 
 
371 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  31.27 
 
 
275 aa  96.3  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 
271 aa  96.3  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.97 
 
 
370 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  24.43 
 
 
258 aa  95.9  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
283 aa  95.9  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 
253 aa  95.1  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  24.3 
 
 
290 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
295 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 
278 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.56 
 
 
299 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.78 
 
 
368 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 
265 aa  95.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  32.27 
 
 
273 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.68 
 
 
370 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  26.33 
 
 
288 aa  94  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>