50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0407 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0398  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  313  4e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0407  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  313  4e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.934587 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0386  hypothetical protein  93.42 
 
 
168 aa  297  4e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0309  hypothetical protein  76.97 
 
 
152 aa  249  8.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0432  hypothetical protein  75.66 
 
 
159 aa  247  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10315  hypothetical protein  67.11 
 
 
163 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.793118 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4383  putative bile acid 7-alpha dehydratase  67.33 
 
 
154 aa  204  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0302  hypothetical protein  52.9 
 
 
163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029098  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2755  hypothetical protein  51.8 
 
 
160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1506  hypothetical protein  37.33 
 
 
170 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640405  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3745  hypothetical protein  36.42 
 
 
187 aa  88.6  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.875835  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3322  hypothetical protein  34.78 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0579422  hitchhiker  0.000746889 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  41.35 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5242  hypothetical protein  39.5 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.766001  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5153  hypothetical protein  39.5 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5534  hypothetical protein  39.5 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  33.9 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  31.2 
 
 
157 aa  59.7  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7188  hypothetical protein  32.81 
 
 
147 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168742  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2186  hypothetical protein  36.84 
 
 
163 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0503259  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  32 
 
 
156 aa  57.4  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4177  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3201  hypothetical protein  25.93 
 
 
156 aa  55.1  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1507  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265161  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  27.27 
 
 
143 aa  54.3  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  31.5 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3815  hypothetical protein  29.77 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  26.89 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  26.77 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  26.89 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  26.89 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0339  hypothetical protein  31.06 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.201274  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  31.36 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  30.37 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  30.7 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3285  hypothetical protein  29.63 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.605935  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  31.15 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3527  hypothetical protein  27.63 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  30.65 
 
 
181 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  27.42 
 
 
146 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  28.8 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0361  hypothetical protein  26.39 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  28.35 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  31.78 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3809  hypothetical protein  27.2 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  25.41 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>