More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0371 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  100 
 
 
577 aa  1164    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  99.64 
 
 
574 aa  1097    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  75.18 
 
 
560 aa  874    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  77.74 
 
 
569 aa  906    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  100 
 
 
577 aa  1164    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  78.65 
 
 
564 aa  910    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  54.49 
 
 
542 aa  559  1e-158  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00517119  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  48.39 
 
 
532 aa  476  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  46.53 
 
 
539 aa  455  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1995  AMP-dependent synthetase and ligase  47.24 
 
 
541 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  43.77 
 
 
527 aa  414  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  45.02 
 
 
548 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  45.22 
 
 
548 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  45.22 
 
 
548 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4817  AMP-dependent synthetase and ligase  43.52 
 
 
541 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  43.56 
 
 
535 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1993  acyl-CoA synthetase  42.41 
 
 
550 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4127  acyl-CoA synthetase  43.29 
 
 
540 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4678  AMP-dependent synthetase and ligase  41.33 
 
 
539 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4103  AMP-dependent synthetase and ligase  43.92 
 
 
545 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4630  AMP-dependent synthetase and ligase  41.29 
 
 
544 aa  388  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4225  acyl-CoA synthetase  42.77 
 
 
530 aa  388  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11456  acyl-CoA synthetase  42.5 
 
 
535 aa  382  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0248769 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2987  AMP-dependent synthetase and ligase  41.28 
 
 
534 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.734432  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0435  acyl-CoA synthetase  42.71 
 
 
544 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0232  acyl-CoA synthetase  42.06 
 
 
544 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253384  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3854  AMP-dependent synthetase and ligase  41.8 
 
 
550 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0051  AMP-dependent synthetase and ligase  39.81 
 
 
546 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00256371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2344  acyl-CoA synthetase  40.94 
 
 
531 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657578  decreased coverage  0.0026015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1066  AMP-dependent synthetase and ligase  39.29 
 
 
560 aa  346  5e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4816  AMP-dependent synthetase and ligase  38.29 
 
 
562 aa  342  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1257  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 
518 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0001  AMP-dependent synthetase and ligase  31.42 
 
 
516 aa  260  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.743652 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  32.93 
 
 
532 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  32.27 
 
 
492 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.8 
 
 
514 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.34 
 
 
512 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  32.62 
 
 
527 aa  240  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  31.17 
 
 
511 aa  241  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  33.85 
 
 
509 aa  239  8e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.96 
 
 
516 aa  239  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 
508 aa  236  7e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 
511 aa  236  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.22 
 
 
497 aa  233  5e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.22 
 
 
497 aa  233  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.13 
 
 
543 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  31.61 
 
 
512 aa  232  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.24 
 
 
514 aa  232  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  31.97 
 
 
510 aa  231  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  31.33 
 
 
509 aa  230  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  31.04 
 
 
516 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.79 
 
 
509 aa  229  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.08 
 
 
509 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.33 
 
 
516 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 
521 aa  228  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.38 
 
 
499 aa  228  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.07 
 
 
525 aa  228  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.33 
 
 
503 aa  227  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  30.04 
 
 
544 aa  227  5.0000000000000005e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  31.51 
 
 
516 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 
540 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.69 
 
 
524 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  31.42 
 
 
523 aa  225  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  30.36 
 
 
500 aa  225  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  30.99 
 
 
487 aa  223  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3426  AMP-binding protein  30.62 
 
 
500 aa  223  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.473482  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  31.06 
 
 
517 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.97 
 
 
501 aa  223  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3127  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.34 
 
 
500 aa  223  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  30.62 
 
 
515 aa  223  7e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  30.62 
 
 
515 aa  223  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  30.43 
 
 
515 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 
508 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  31.76 
 
 
525 aa  222  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 
519 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  31.38 
 
 
501 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 
516 aa  220  5e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.08 
 
 
516 aa  220  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  31.9 
 
 
512 aa  220  6e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  31.92 
 
 
546 aa  220  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  31.19 
 
 
501 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  31.19 
 
 
501 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.46 
 
 
514 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 
501 aa  219  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3117  AMP-dependent synthetase and ligase  29.88 
 
 
500 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2438  AMP-dependent synthetase and ligase  31.53 
 
 
512 aa  219  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.4 
 
 
514 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.14 
 
 
510 aa  219  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3605  acyl-CoA synthetase  31.35 
 
 
514 aa  217  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133038  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2738  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.98 
 
 
522 aa  217  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  29.76 
 
 
514 aa  217  5e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  30.5 
 
 
516 aa  217  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.55 
 
 
515 aa  217  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3453  AMP-binding protein  29.68 
 
 
500 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.94 
 
 
510 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 
512 aa  217  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 
518 aa  217  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  32 
 
 
513 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.74 
 
 
510 aa  216  7e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.94 
 
 
510 aa  216  7e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>