More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0363 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0346  xanthine/uracil/vitamin C permease  83.44 
 
 
470 aa  707    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0353  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 
471 aa  893    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.457935  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0342  xanthine/uracil/vitamin C permease  99.79 
 
 
471 aa  890    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0363  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 
471 aa  893    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.92632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0392  xanthine/uracil/vitamin C permease  84.71 
 
 
470 aa  730    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3423  xanthine/uracil/vitamin C permease  64.56 
 
 
498 aa  547  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3203  Xanthine/uracil/vitamin C permease  63.03 
 
 
521 aa  537  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1251  Xanthine/uracil/vitamin C permease  61.97 
 
 
491 aa  533  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.481719  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0138  Xanthine/uracil/vitamin C permease  57.71 
 
 
486 aa  474  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33970  permease  53.86 
 
 
488 aa  451  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114648  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0488  Xanthine/uracil/vitamin C permease  57.95 
 
 
479 aa  446  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3290  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.49 
 
 
506 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0025  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.2 
 
 
515 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2925  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.65 
 
 
491 aa  425  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703881  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0817  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.01 
 
 
507 aa  420  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0601  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.26 
 
 
481 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000948435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8894  xanthine/uracil/vitamin C transporter  48.96 
 
 
487 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3129  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.57 
 
 
475 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337954  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0380  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.31 
 
 
480 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0864  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.1 
 
 
517 aa  409  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214606  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2567  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.74 
 
 
461 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.390928 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0416  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.21 
 
 
490 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.355701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0504  xanthine/uracil/vitamin C permease  52 
 
 
490 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30830  permease  48.76 
 
 
494 aa  410  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.896956  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3928  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.68 
 
 
491 aa  409  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8411  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.26 
 
 
463 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24090  permease  50 
 
 
484 aa  401  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2543  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.84 
 
 
483 aa  391  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0284041  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1382  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.87 
 
 
488 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0835214  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0240  putative xanthine/uracil permease  46.11 
 
 
493 aa  386  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1996  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.17 
 
 
518 aa  378  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17840  permease  51.4 
 
 
496 aa  378  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.457216  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4178  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.84 
 
 
484 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.214839  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13510  permease  45.11 
 
 
502 aa  362  1e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2228  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.49 
 
 
480 aa  355  6.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  0.0422886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4306  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.26 
 
 
465 aa  312  9e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0597  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.27 
 
 
496 aa  311  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3345  xanthine/uracil/vitamin C transporter  42.49 
 
 
456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.22 
 
 
442 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.77 
 
 
456 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3490  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.77 
 
 
456 aa  296  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534774  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2607  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.69 
 
 
466 aa  283  3.0000000000000004e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3412  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.99 
 
 
460 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.992629  normal  0.11074 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.9 
 
 
463 aa  281  3e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.62 
 
 
460 aa  276  6e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.11 
 
 
462 aa  261  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.77 
 
 
457 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.05 
 
 
433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.99 
 
 
440 aa  253  4.0000000000000004e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.56 
 
 
441 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  33.77 
 
 
437 aa  251  2e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.99 
 
 
441 aa  250  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.29 
 
 
441 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  34.47 
 
 
444 aa  248  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.71 
 
 
442 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  35.71 
 
 
442 aa  249  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  35.71 
 
 
442 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.77 
 
 
471 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0727  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38 
 
 
458 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3169  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.8 
 
 
442 aa  247  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000290647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1251  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.7 
 
 
465 aa  246  8e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000260393  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2522  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.53 
 
 
438 aa  246  9e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.013559  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  34.77 
 
 
429 aa  246  9e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0783  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.71 
 
 
431 aa  245  9.999999999999999e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.375891  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0766  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.64 
 
 
438 aa  245  9.999999999999999e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.383073  normal  0.743941 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  35.79 
 
 
430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.27 
 
 
431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0281  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.99 
 
 
436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681236  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  34.72 
 
 
429 aa  244  3.9999999999999997e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.55 
 
 
429 aa  243  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0021  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.72 
 
 
445 aa  243  6e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.395104 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0570  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.32 
 
 
438 aa  243  7e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.46787  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  38.66 
 
 
430 aa  243  7.999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.83 
 
 
444 aa  242  9e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.83 
 
 
444 aa  242  9e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.42 
 
 
454 aa  242  9e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  38.53 
 
 
430 aa  241  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.23 
 
 
453 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.55 
 
 
429 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.78 
 
 
446 aa  240  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  34.13 
 
 
436 aa  240  4e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.23 
 
 
430 aa  239  8e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.95 
 
 
432 aa  239  9e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.78 
 
 
446 aa  239  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  32.24 
 
 
429 aa  238  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.2 
 
 
446 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  31.84 
 
 
467 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  33.91 
 
 
429 aa  238  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1753  xanthine/uracil permease family protein  35.1 
 
 
482 aa  236  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99321  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.48 
 
 
429 aa  236  7e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2111  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.79 
 
 
428 aa  236  9e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000533126  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.33 
 
 
429 aa  236  9e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  33.48 
 
 
445 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  33.48 
 
 
445 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3956  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.15 
 
 
449 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550955  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2421  xanthine/uracil/vitamin C permease  32.75 
 
 
443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.19 
 
 
431 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.21 
 
 
430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0209  Xanthine/uracil/vitamin C permease  33.06 
 
 
476 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.746672  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2527  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.95 
 
 
444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.368173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>