More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0341 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  394  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  394  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  98.97 
 
 		 195 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  75.53 
 
 		 196 aa  293  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  77.05 
 
 		 194 aa  281  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  52.6 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 207 aa  158  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  44.51 
 
 		 211 aa  157  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 202 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  42.63 
 
 		 200 aa  144  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2518  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 203 aa  128  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 206 aa  123  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3220  putative regulatory protein  45.11 
 
 		 145 aa  114  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 232 aa  57.8  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  35.62 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 285 aa  53.9  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  33.05 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  30.82 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2470  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 287 aa  52.4  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 224 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2892  regulatory protein, TetR  40.74 
 
 		 635 aa  51.6  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794047  normal  0.565465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 222 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 222 aa  51.2  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 215 aa  51.2  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 227 aa  51.2  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 243 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 600 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 216 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 239 aa  49.3  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 229 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6235  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.706195 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  38.24 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>