More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0304 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
264 aa  529  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
264 aa  529  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  99.24 
 
 
264 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.63 
 
 
261 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2633  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.88 
 
 
276 aa  340  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.364215  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3511  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.23 
 
 
264 aa  323  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.531457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.4 
 
 
256 aa  218  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.93 
 
 
265 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0163274 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 
270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.155625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
270 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.442455  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
270 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0110329  normal  0.0245266 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.79 
 
 
275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.320564  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.73 
 
 
268 aa  145  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
271 aa  142  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
272 aa  125  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.87 
 
 
276 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3574  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 
267 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259441  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 
266 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263195  hitchhiker  0.00574732 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.52 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708406  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.892025  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
344 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
261 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000362575 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 
266 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0124  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.24 
 
 
269 aa  109  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
273 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127379  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
271 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
269 aa  106  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
268 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.700313  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 
262 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 
262 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
267 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 
262 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 
298 aa  102  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0468951  hitchhiker  0.00252787 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2064  oxidoreductase ( short-chain dehydrogenase)  31.36 
 
 
264 aa  102  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.694867  normal  0.0846624 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 
268 aa  102  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 
261 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.48 
 
 
256 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227726  hitchhiker  0.00265893 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2362  short chain oxidoreductase  49.52 
 
 
128 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0558565 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79198  beta-hydroxysteroid dehydrogenase type 3  32.92 
 
 
346 aa  100  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.103283  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35320  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  36.65 
 
 
249 aa  99.8  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135035  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 
261 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308915  normal  0.0922746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.57 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2063  short-chain dehydrogenase  30.77 
 
 
261 aa  97.1  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247773  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
250 aa  96.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.92313 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
266 aa  96.3  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642907  decreased coverage  0.0040913 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
264 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179752 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
261 aa  95.5  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000113464  decreased coverage  0.000120518 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  34.76 
 
 
267 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3857  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 
263 aa  95.1  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1015  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.47 
 
 
263 aa  94  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.79 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
259 aa  94  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.6 
 
 
254 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1706  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951732  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.662669  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 
258 aa  92.8  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.18 
 
 
257 aa  92.8  5e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1145  short chain dehydrogenase  29.47 
 
 
321 aa  92.8  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
266 aa  92.4  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498015  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1227  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
261 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198957  normal  0.373488 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
261 aa  92.4  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00690  ketoreductase, putative  30.84 
 
 
361 aa  91.7  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
258 aa  91.3  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.8 
 
 
281 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.8 
 
 
281 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.699263 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
252 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.092001  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2321  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  36.46 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.195083 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3335  hypothetical protein  35.09 
 
 
249 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.255614 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0666  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 
343 aa  90.9  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.019294  hitchhiker  0.000464867 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3647  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 
255 aa  91.3  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.02 
 
 
266 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177624  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.9 
 
 
271 aa  90.5  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
360 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.04 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 
264 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.576998  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
261 aa  89.7  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.596662  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 
262 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 
255 aa  90.1  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000634692  hitchhiker  0.00117931 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 
262 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.24 
 
 
265 aa  89.7  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.15 
 
 
263 aa  89.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  32.82 
 
 
266 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
257 aa  89  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.42 
 
 
259 aa  89  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 
259 aa  89  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
263 aa  88.6  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 
267 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 
267 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12531  short-chain type dehydrogenase/reductase  32.62 
 
 
268 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.35 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.75 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>