More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0256 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  81 
 
 
1001 aa  1586    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  58.16 
 
 
1002 aa  1129    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  100 
 
 
998 aa  1986    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  49.45 
 
 
1146 aa  966    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  48.17 
 
 
1062 aa  907    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  40.32 
 
 
1022 aa  659    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  100 
 
 
998 aa  1986    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  48.17 
 
 
1062 aa  907    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  40.32 
 
 
1022 aa  659    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  88.42 
 
 
1000 aa  1721    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  41.46 
 
 
1028 aa  639    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  41.61 
 
 
1003 aa  670    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  40.56 
 
 
1013 aa  644    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  99.9 
 
 
998 aa  1984    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  48.58 
 
 
1077 aa  932    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  41.04 
 
 
1040 aa  645    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  52.74 
 
 
1089 aa  1015    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  32.11 
 
 
1011 aa  466  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  33.27 
 
 
1013 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  29.83 
 
 
967 aa  434  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  29.89 
 
 
941 aa  425  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  29.57 
 
 
944 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3435  transport protein  29.92 
 
 
968 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541306  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5174  transport protein  29.87 
 
 
968 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5555  transport protein  29.87 
 
 
968 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188099  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5263  transport protein  29.87 
 
 
968 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3189  transport protein  29.82 
 
 
968 aa  413  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  29.78 
 
 
948 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3401  transport protein  29.94 
 
 
955 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.057109  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  29.73 
 
 
962 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3464  transport protein  29.94 
 
 
955 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0593599 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2705  transport protein  30.88 
 
 
957 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3412  transport protein  29.94 
 
 
955 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0674616  normal  0.562796 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4825  transport protein  29.46 
 
 
1001 aa  398  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  29.26 
 
 
945 aa  399  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  29.26 
 
 
945 aa  399  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1614  transport protein  29.04 
 
 
968 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0481 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10407  transmembrane transport protein mmpL1  28.79 
 
 
958 aa  389  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.665513  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  29.06 
 
 
959 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10690  transmembrane transport protein mmpL5  29.2 
 
 
964 aa  383  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10518  transmembrane transport protein mmpL2  28.54 
 
 
968 aa  363  1e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.930398 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1057  transport protein  28.05 
 
 
963 aa  351  4e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  40.85 
 
 
681 aa  350  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11778  MmpL family membrane protein  29.2 
 
 
945 aa  344  5.999999999999999e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000786949  decreased coverage  0.0000000000113435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4635  MMPL domain-containing protein  45.54 
 
 
470 aa  313  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  25.63 
 
 
1109 aa  311  2.9999999999999997e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  25 
 
 
1109 aa  308  3e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  25.81 
 
 
1054 aa  288  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  24.62 
 
 
1040 aa  272  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  23.41 
 
 
1049 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  24.17 
 
 
1038 aa  249  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  26.68 
 
 
1068 aa  247  6e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  24.29 
 
 
1038 aa  244  7e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  24.6 
 
 
1038 aa  239  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  24.04 
 
 
1038 aa  238  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2691  MmpL family membrane protein  23.78 
 
 
1041 aa  237  7e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.475251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2287  membrane protein, MmpL family  24.41 
 
 
1038 aa  237  9e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0482318  hitchhiker  0.0000000000000416433 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  23.26 
 
 
1041 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2949  putative membrane protein, MmpL family  25 
 
 
888 aa  209  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4025e-34 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11589  transmembrane transport protein mmpL6  39.39 
 
 
397 aa  193  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.9101799999999998e-86  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0890  MMPL domain protein  19.9 
 
 
1026 aa  181  8e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000250771  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  26.94 
 
 
974 aa  167  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  26.68 
 
 
981 aa  162  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  38.62 
 
 
974 aa  161  5e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  40.93 
 
 
743 aa  150  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  40.93 
 
 
743 aa  150  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  40.51 
 
 
743 aa  150  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  40.93 
 
 
743 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  40.93 
 
 
743 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  40.85 
 
 
753 aa  150  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  43.96 
 
 
750 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  42.27 
 
 
764 aa  149  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  39.75 
 
 
743 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  40.51 
 
 
743 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  39.15 
 
 
743 aa  145  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  39.66 
 
 
743 aa  145  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  40.93 
 
 
743 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2741  hypothetical protein  23.12 
 
 
810 aa  142  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  38.7 
 
 
712 aa  142  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  41.04 
 
 
576 aa  140  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  30.65 
 
 
730 aa  137  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  41.41 
 
 
709 aa  136  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  41.28 
 
 
737 aa  136  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  31.97 
 
 
713 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  37.05 
 
 
674 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  37.05 
 
 
674 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  37.05 
 
 
674 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  32.59 
 
 
882 aa  133  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  45.13 
 
 
780 aa  132  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.66 
 
 
697 aa  130  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  37.8 
 
 
699 aa  129  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  35.27 
 
 
702 aa  127  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  32.92 
 
 
740 aa  127  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  45.36 
 
 
713 aa  126  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  36.93 
 
 
673 aa  126  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  40.79 
 
 
745 aa  126  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  45.55 
 
 
699 aa  126  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  48.47 
 
 
706 aa  125  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  25.89 
 
 
723 aa  125  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  36.36 
 
 
747 aa  125  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.017354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>